More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4282 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  71.45 
 
 
555 aa  807    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  60.75 
 
 
572 aa  641    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  93.86 
 
 
554 aa  1039    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  59.15 
 
 
536 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  63.02 
 
 
539 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  100 
 
 
559 aa  1112    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  62.5 
 
 
569 aa  669    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  60.14 
 
 
562 aa  644    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  61.57 
 
 
574 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  57.04 
 
 
560 aa  629  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  60.43 
 
 
561 aa  628  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  57.34 
 
 
571 aa  606  9.999999999999999e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  56.51 
 
 
564 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  58.17 
 
 
542 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  57.5 
 
 
560 aa  598  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  60.32 
 
 
558 aa  594  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  58.29 
 
 
539 aa  585  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  58.08 
 
 
544 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  53.17 
 
 
553 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  57.84 
 
 
543 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
488 aa  313  6.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.97 
 
 
620 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.06 
 
 
690 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.68 
 
 
643 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.15 
 
 
668 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.23 
 
 
549 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.27 
 
 
709 aa  196  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  31.42 
 
 
645 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.91 
 
 
659 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.52 
 
 
636 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.32 
 
 
767 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.36 
 
 
644 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  31.53 
 
 
664 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  27.2 
 
 
642 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  29.76 
 
 
543 aa  184  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  27.2 
 
 
642 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  32.21 
 
 
657 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  28.32 
 
 
663 aa  183  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  27.95 
 
 
663 aa  183  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  27 
 
 
622 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.48 
 
 
649 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  28.28 
 
 
879 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 
645 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  30.5 
 
 
545 aa  181  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  31 
 
 
540 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  30.43 
 
 
649 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  28.79 
 
 
543 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  31.56 
 
 
649 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  26.83 
 
 
685 aa  179  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  29.16 
 
 
723 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  29.05 
 
 
636 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.09 
 
 
634 aa  178  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30.56 
 
 
540 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  28.78 
 
 
555 aa  177  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  29.7 
 
 
544 aa  177  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  24.65 
 
 
620 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  31.51 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  31.6 
 
 
641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  29.39 
 
 
620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  26.3 
 
 
641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  28.27 
 
 
635 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  29.7 
 
 
621 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.39 
 
 
557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 
557 aa  174  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.37 
 
 
545 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  29.7 
 
 
621 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  30.43 
 
 
631 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.7 
 
 
558 aa  174  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  27.86 
 
 
552 aa  173  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  28.18 
 
 
644 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.49 
 
 
554 aa  172  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2430  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.16 
 
 
595 aa  172  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  27.92 
 
 
630 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
688 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  30.66 
 
 
530 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  30.16 
 
 
659 aa  171  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.94 
 
 
555 aa  171  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  28.96 
 
 
540 aa  171  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  27.83 
 
 
575 aa  170  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  27.78 
 
 
641 aa  170  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  27.89 
 
 
638 aa  170  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  28.7 
 
 
621 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  25.78 
 
 
639 aa  169  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  29.16 
 
 
542 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  27.69 
 
 
638 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  28.34 
 
 
672 aa  169  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_002620  TC0627  ABC transporter, ATP-binding protein  28.06 
 
 
528 aa  168  2e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.261248  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  26.03 
 
 
621 aa  168  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.78 
 
 
554 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.78 
 
 
554 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  26.46 
 
 
546 aa  168  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  30.42 
 
 
529 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  27.82 
 
 
644 aa  169  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  26.94 
 
 
636 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  26.65 
 
 
630 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  27.31 
 
 
666 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  29.24 
 
 
623 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3159  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.93 
 
 
555 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000146292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  31.29 
 
 
532 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  28.19 
 
 
555 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>