More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3891 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  62.59 
 
 		 569 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  62.68 
 
 		 539 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  100 
 
 		 554 aa  1102    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  60.57 
 
 		 572 aa  641    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  60.9 
 
 		 562 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  93.86 
 
 		 559 aa  1021    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  70.89 
 
 		 555 aa  795    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  61.57 
 
 		 574 aa  672    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  60.04 
 
 		 536 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  57.73 
 
 		 560 aa  632  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 561 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  57.98 
 
 		 571 aa  614  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  57.55 
 
 		 564 aa  609  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  58.06 
 
 		 560 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  59.89 
 
 		 558 aa  591  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  58.72 
 
 		 542 aa  584  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  58.63 
 
 		 539 aa  580  1e-164  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  59.64 
 
 		 544 aa  578  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  58.42 
 
 		 543 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  52.93 
 
 		 553 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  43.99 
 
 		 488 aa  312  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.82 
 
 		 620 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.16 
 
 		 690 aa  204  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.51 
 
 		 643 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.01 
 
 		 549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.26 
 
 		 668 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.02 
 
 		 709 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.1 
 
 		 659 aa  193  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  30.09 
 
 		 543 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.64 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.53 
 
 		 649 aa  190  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  30.36 
 
 		 540 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  32.4 
 
 		 657 aa  186  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.6 
 
 		 767 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.32 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  27.52 
 
 		 622 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30.21 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 		 545 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  30.09 
 
 		 649 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  26.94 
 
 		 644 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.22 
 
 		 641 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50537  predicted protein  29.47 
 
 		 879 aa  181  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.437528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1466  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.64 
 
 		 558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000105508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  27.36 
 
 		 642 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  27.36 
 
 		 642 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  29.81 
 
 		 645 aa  181  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  30.76 
 
 		 645 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  30.91 
 
 		 664 aa  180  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  29.55 
 
 		 635 aa  180  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  28.93 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  29.82 
 
 		 631 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2991  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.96 
 
 		 559 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.26 
 
 		 557 aa  179  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  29.4 
 
 		 636 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  29.29 
 
 		 543 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  30.02 
 
 		 659 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0416  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.94 
 
 		 553 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.42 
 
 		 557 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  27.94 
 
 		 663 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  27.58 
 
 		 663 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.36 
 
 		 634 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  27.36 
 
 		 641 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  28.95 
 
 		 723 aa  176  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  26.87 
 
 		 639 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  28.62 
 
 		 630 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4119  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.21 
 
 		 555 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5234  ABC transporter related protein  28.95 
 
 		 555 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.29 
 
 		 639 aa  174  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1060  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.44 
 
 		 554 aa  174  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  27.93 
 
 		 653 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  28.84 
 
 		 638 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  29.1 
 
 		 542 aa  173  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  27.88 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  25.27 
 
 		 620 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  29.36 
 
 		 659 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  27.47 
 
 		 685 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  30.49 
 
 		 630 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  25.18 
 
 		 627 aa  172  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  29.72 
 
 		 630 aa  172  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  27.52 
 
 		 638 aa  172  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  29.3 
 
 		 625 aa  172  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  30.56 
 
 		 649 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  27.44 
 
 		 631 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  28.28 
 
 		 540 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.94 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12061  ABC transporter ATPase  27.8 
 
 		 644 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.393632  normal  0.504812 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  26.74 
 
 		 621 aa  171  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  30.94 
 
 		 530 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  31.26 
 
 		 615 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  29.21 
 
 		 672 aa  171  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  29.51 
 
 		 545 aa  171  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1864  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.4 
 
 		 560 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.733773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  28.11 
 
 		 644 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  28.55 
 
 		 632 aa  170  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  28.03 
 
 		 636 aa  170  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03991  ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 		 652 aa  170  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  27.69 
 
 		 631 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  27.62 
 
 		 632 aa  170  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  28.28 
 
 		 533 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  28.03 
 
 		 653 aa  169  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>