More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02910 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  67.14 
 
 		 572 aa  720    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  62.06 
 
 		 561 aa  658    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  65.5 
 
 		 558 aa  657    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  63.24 
 
 		 562 aa  696    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  100 
 
 		 571 aa  1140    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  65.5 
 
 		 564 aa  700    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  64.97 
 
 		 560 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  65.32 
 
 		 560 aa  712    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  65.03 
 
 		 569 aa  712    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  62.54 
 
 		 574 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  63.22 
 
 		 539 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  58.57 
 
 		 536 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  59.72 
 
 		 544 aa  618  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  59.51 
 
 		 542 aa  616  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  57.98 
 
 		 554 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  57.34 
 
 		 559 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 539 aa  590  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  54.64 
 
 		 555 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  53.21 
 
 		 553 aa  537  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  55.44 
 
 		 543 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 488 aa  312  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  29.56 
 
 		 651 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  29.82 
 
 		 650 aa  194  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  28.89 
 
 		 636 aa  194  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  28.94 
 
 		 652 aa  190  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  29.23 
 
 		 620 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.12 
 
 		 643 aa  189  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.75 
 
 		 639 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  31.46 
 
 		 549 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  29.02 
 
 		 636 aa  187  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  28.57 
 
 		 636 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  28.6 
 
 		 666 aa  187  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  27.77 
 
 		 639 aa  187  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  29.33 
 
 		 543 aa  187  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  28.05 
 
 		 652 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  27.06 
 
 		 627 aa  184  3e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  28.34 
 
 		 656 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  29.76 
 
 		 645 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  32.93 
 
 		 657 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0284  ABC transporter, ATP-binding protein  29.48 
 
 		 662 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.541093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  31.38 
 
 		 644 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  29.06 
 
 		 650 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  29.78 
 
 		 690 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  26.75 
 
 		 632 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  29.48 
 
 		 644 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.03 
 
 		 644 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.39 
 
 		 659 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0262  ABC transporter ATP-binding protein  29.48 
 
 		 640 aa  181  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00579905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0248  ABC transporter ATP-binding protein  29.48 
 
 		 658 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0234  ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 		 658 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0393194  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0236  ABC transporter, ATP-binding protein  29.48 
 
 		 658 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281236  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  29.82 
 
 		 528 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0288  ABC transporter, ATP-binding protein  29.48 
 
 		 658 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  28.32 
 
 		 663 aa  180  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  28.8 
 
 		 653 aa  180  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  29.66 
 
 		 530 aa  180  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  28.89 
 
 		 658 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  29.62 
 
 		 544 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  29.02 
 
 		 767 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  29.29 
 
 		 530 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  29.29 
 
 		 530 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  29.29 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  30.08 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  29.31 
 
 		 641 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1681  ABC transporter related  29.29 
 
 		 522 aa  177  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  29.93 
 
 		 649 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  28.11 
 
 		 663 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  26.42 
 
 		 634 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  29.29 
 
 		 530 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0293  ABC transporter, ATP-binding protein  29.42 
 
 		 659 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0524615  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  29.73 
 
 		 649 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  28.92 
 
 		 644 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  29.7 
 
 		 649 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  29.05 
 
 		 540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  29.62 
 
 		 633 aa  174  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  28.79 
 
 		 668 aa  174  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  29.66 
 
 		 528 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  28.08 
 
 		 531 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  32.05 
 
 		 615 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  31.87 
 
 		 615 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  28.11 
 
 		 685 aa  173  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  26.28 
 
 		 646 aa  173  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3627  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.24 
 
 		 551 aa  173  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  27.4 
 
 		 630 aa  173  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  29.44 
 
 		 709 aa  173  9e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 		 545 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  27.12 
 
 		 653 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  29.78 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 599 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  28.47 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  28.47 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  31.68 
 
 		 642 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  29.37 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  29.98 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  28.17 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 599 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  29.11 
 
 		 599 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>