More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1583 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  60.93 
 
 		 536 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  63.9 
 
 		 539 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  100 
 
 		 542 aa  1076    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  59.36 
 
 		 561 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  61.76 
 
 		 569 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  66.79 
 
 		 539 aa  703    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  59.51 
 
 		 571 aa  635    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  62.43 
 
 		 544 aa  633  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  59.31 
 
 		 553 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  57.63 
 
 		 560 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  57.69 
 
 		 574 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  56.76 
 
 		 562 aa  611  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  58.17 
 
 		 559 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  58.72 
 
 		 554 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  57.5 
 
 		 560 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  57.73 
 
 		 564 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  57.71 
 
 		 572 aa  601  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  61.29 
 
 		 558 aa  591  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  53.89 
 
 		 555 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  57.61 
 
 		 543 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  45.47 
 
 		 488 aa  339  5.9999999999999996e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  33.07 
 
 		 620 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  31.29 
 
 		 528 aa  205  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.31 
 
 		 639 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.7 
 
 		 649 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.63 
 
 		 659 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  31.37 
 
 		 767 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  30.66 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  31.3 
 
 		 522 aa  198  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0945  ABC transporter related  29.67 
 
 		 544 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000191472 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 533 aa  197  5.000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.54 
 
 		 634 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3303  ABC transporter related protein  29.27 
 
 		 544 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.68 
 
 		 543 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  32.95 
 
 		 632 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  32.02 
 
 		 653 aa  195  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  29.55 
 
 		 540 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  26.92 
 
 		 627 aa  193  8e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  31.05 
 
 		 652 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.04 
 
 		 645 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  30.11 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  33.39 
 
 		 649 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  29.62 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  30 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  30 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  30.26 
 
 		 636 aa  190  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  30 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  30.12 
 
 		 531 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  30 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  30.78 
 
 		 668 aa  190  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  30.06 
 
 		 530 aa  190  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 		 530 aa  190  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  28.71 
 
 		 520 aa  190  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  29.86 
 
 		 531 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  30.26 
 
 		 530 aa  189  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  31.24 
 
 		 546 aa  189  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  30.39 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  29.86 
 
 		 587 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.3 
 
 		 690 aa  189  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  30.6 
 
 		 656 aa  189  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  28.54 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  29.48 
 
 		 651 aa  189  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  29.81 
 
 		 531 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  29.81 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  30.14 
 
 		 652 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.24 
 
 		 545 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  32.68 
 
 		 657 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.57 
 
 		 643 aa  188  3e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3550  ABC transporter related  28.38 
 
 		 545 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000348085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.35 
 
 		 634 aa  188  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30.87 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  31.75 
 
 		 528 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  29.98 
 
 		 575 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2634  ABC-type transport system, ATPase component  28.09 
 
 		 544 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285179  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  29.71 
 
 		 557 aa  186  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.47 
 
 		 644 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  28.95 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3011  ABC transporter related  28.36 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00994639  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  31.21 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  30.87 
 
 		 540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  26.8 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2949  ABC transporter related  29.47 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000330729  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  28.05 
 
 		 642 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  28.05 
 
 		 642 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  30.39 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  28.06 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0820  ABC transporter related  29.49 
 
 		 527 aa  184  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.354226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 634 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  29.73 
 
 		 529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  30.13 
 
 		 632 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  28.08 
 
 		 535 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  29.9 
 
 		 528 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  31.37 
 
 		 528 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>