More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2749 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  62.63 
 
 		 562 aa  702    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  62.06 
 
 		 571 aa  684    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  64.88 
 
 		 539 aa  687    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  59.18 
 
 		 555 aa  641    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  67.86 
 
 		 569 aa  742    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  60.96 
 
 		 564 aa  669    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  60.43 
 
 		 559 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  64.53 
 
 		 558 aa  650    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  100 
 
 		 561 aa  1125    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  65.6 
 
 		 539 aa  686    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  62.21 
 
 		 560 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  66.19 
 
 		 572 aa  724    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  59.36 
 
 		 542 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  60.78 
 
 		 560 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  63.88 
 
 		 536 aa  707    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  60.58 
 
 		 554 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  63.77 
 
 		 544 aa  668    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  65.56 
 
 		 574 aa  728    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  58.83 
 
 		 553 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  61.32 
 
 		 543 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 488 aa  332  8e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.26 
 
 		 767 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.36 
 
 		 643 aa  200  5e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.22 
 
 		 549 aa  200  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  31.38 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.34 
 
 		 620 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  31.68 
 
 		 540 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  29.34 
 
 		 668 aa  197  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  30.67 
 
 		 649 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  30.87 
 
 		 645 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  30.98 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  30.98 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.4 
 
 		 659 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  30.52 
 
 		 690 aa  190  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.83 
 
 		 545 aa  190  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2072  ABC transporter related protein  34.3 
 
 		 533 aa  190  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  26.58 
 
 		 620 aa  190  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  26.36 
 
 		 627 aa  189  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.46 
 
 		 544 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  29.41 
 
 		 653 aa  187  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  29.75 
 
 		 649 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  28.26 
 
 		 637 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  27.48 
 
 		 650 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  28.2 
 
 		 639 aa  184  3e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  26.94 
 
 		 641 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  28.28 
 
 		 632 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0830  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  32.5 
 
 		 673 aa  183  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  30.19 
 
 		 529 aa  183  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  27.4 
 
 		 653 aa  183  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  28.41 
 
 		 530 aa  183  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  32.23 
 
 		 548 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  27.71 
 
 		 634 aa  183  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  28.37 
 
 		 651 aa  183  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  29.25 
 
 		 545 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  32.04 
 
 		 548 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  29.47 
 
 		 709 aa  182  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  31.68 
 
 		 545 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  30.23 
 
 		 659 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  31.38 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  28.93 
 
 		 638 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0764  ABC transporter related  27.94 
 
 		 652 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.687969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  30.91 
 
 		 542 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  29.66 
 
 		 540 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  30.91 
 
 		 633 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  27.55 
 
 		 642 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  28.6 
 
 		 644 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  30.15 
 
 		 641 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  31.32 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.62 
 
 		 636 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  29.96 
 
 		 632 aa  178  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0876  ABC transporter-related protein  32.5 
 
 		 673 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  30.7 
 
 		 528 aa  178  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  28.19 
 
 		 631 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2483  ABC transporter related  32.56 
 
 		 542 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1948  ABC transporter related  28.29 
 
 		 650 aa  177  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  33.46 
 
 		 536 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  29.3 
 
 		 530 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2446  ABC transporter related  32.56 
 
 		 542 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 		 642 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2491  ABC transporter related  32.56 
 
 		 542 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2742  ABC transporter-related protein  32.22 
 
 		 563 aa  177  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676431 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  28.89 
 
 		 521 aa  177  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3668  ABC transporter related  32.65 
 
 		 542 aa  177  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39123  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  25.26 
 
 		 622 aa  176  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  25.44 
 
 		 621 aa  176  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  30.07 
 
 		 672 aa  176  8e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2910  ABC transporter related  30.88 
 
 		 537 aa  176  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  28.25 
 
 		 631 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  28.25 
 
 		 631 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3917  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.86 
 
 		 554 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  29.1 
 
 		 528 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  30.18 
 
 		 575 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  29.95 
 
 		 540 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 		 528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  28.22 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  26.92 
 
 		 636 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 631 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 631 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  30.73 
 
 		 540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>