More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7235 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  63.1 
 
 		 569 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  100 
 
 		 543 aa  1083    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  69.19 
 
 		 536 aa  751    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  61.32 
 
 		 561 aa  640    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  63.85 
 
 		 539 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  60.88 
 
 		 574 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  62.45 
 
 		 539 aa  633  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  62.02 
 
 		 544 aa  628  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  57.96 
 
 		 560 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  57.98 
 
 		 562 aa  624  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  60.71 
 
 		 572 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  56.08 
 
 		 555 aa  606  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  58.61 
 
 		 554 aa  600  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  57.96 
 
 		 564 aa  595  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  57.3 
 
 		 553 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  57.6 
 
 		 559 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  58.57 
 
 		 560 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  57.61 
 
 		 542 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.44 
 
 		 571 aa  569  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  59.32 
 
 		 558 aa  561  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.94 
 
 		 668 aa  221  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.07 
 
 		 709 aa  216  5.9999999999999996e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.29 
 
 		 690 aa  213  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  29.11 
 
 		 622 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.77 
 
 		 620 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  27.69 
 
 		 627 aa  207  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  29.96 
 
 		 636 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.56 
 
 		 643 aa  203  5e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  30.62 
 
 		 636 aa  200  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  29.13 
 
 		 634 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 767 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  33.08 
 
 		 540 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  32.82 
 
 		 543 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  32.63 
 
 		 540 aa  196  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  32.23 
 
 		 543 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.63 
 
 		 549 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  27.79 
 
 		 621 aa  194  3e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.75 
 
 		 639 aa  194  3e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  29.5 
 
 		 630 aa  194  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  31.7 
 
 		 544 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.42 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 641 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.87 
 
 		 634 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  28.13 
 
 		 641 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  27.02 
 
 		 620 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  31.23 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.48 
 
 		 649 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  29.78 
 
 		 645 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  32.12 
 
 		 615 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  31.86 
 
 		 542 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  30.64 
 
 		 649 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  31.75 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  30.83 
 
 		 644 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  29.33 
 
 		 649 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0493  ABC transporter related  33.46 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  30.91 
 
 		 633 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.35 
 
 		 659 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl053  multidrug ABC transporter ATP-binding component  29.67 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  30.5 
 
 		 672 aa  184  4.0000000000000006e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  27.94 
 
 		 632 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  29.53 
 
 		 628 aa  183  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  30.29 
 
 		 645 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  31.56 
 
 		 627 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  30.27 
 
 		 640 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  29.25 
 
 		 647 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  29.46 
 
 		 631 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  29.46 
 
 		 631 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  32.67 
 
 		 644 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.4 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  30.02 
 
 		 641 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  29.53 
 
 		 643 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  27.06 
 
 		 666 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  30.36 
 
 		 648 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  31 
 
 		 540 aa  181  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 631 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0368  ABC transporter related  26.08 
 
 		 606 aa  181  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  28.24 
 
 		 645 aa  181  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.09 
 
 		 529 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4945  ABC transporter related  29.22 
 
 		 561 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  28.26 
 
 		 663 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4062  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.18 
 
 		 554 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.247157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  29.9 
 
 		 545 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  30.4 
 
 		 621 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3681  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.57 
 
 		 553 aa  180  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  31.42 
 
 		 540 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  30.78 
 
 		 723 aa  180  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4024  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.51 
 
 		 554 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.640286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  33.8 
 
 		 613 aa  180  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  28.74 
 
 		 688 aa  179  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  31.42 
 
 		 540 aa  180  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  29.47 
 
 		 625 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  29.47 
 
 		 625 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  28.36 
 
 		 630 aa  179  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  28.35 
 
 		 638 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  29.1 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2084  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.36 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.695655  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4057  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.51 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2171  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 		 553 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>