More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4945 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4945  ABC transporter related  100 
 
 
561 aa  1149    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  35.5 
 
 
643 aa  372  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  37.5 
 
 
636 aa  365  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  34.24 
 
 
640 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  33.77 
 
 
639 aa  351  2e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  32.62 
 
 
634 aa  340  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0351  ABC transporter related  35.03 
 
 
645 aa  337  3.9999999999999995e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 
636 aa  337  5e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  36.75 
 
 
767 aa  337  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  33.64 
 
 
666 aa  333  4e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  34.29 
 
 
638 aa  331  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  36.3 
 
 
641 aa  329  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  36.4 
 
 
564 aa  329  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  35.6 
 
 
636 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  36.12 
 
 
575 aa  329  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  34.63 
 
 
639 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  35.56 
 
 
644 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  35.74 
 
 
581 aa  326  8.000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0238  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
626 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  35.68 
 
 
659 aa  323  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  34.31 
 
 
642 aa  323  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  34.31 
 
 
642 aa  323  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0245  ABC transporter, ATP-binding protein  36.25 
 
 
626 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  33.02 
 
 
634 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0217  ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
626 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0228  ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 
626 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5082  ABC transporter, ATP-binding protein  36.22 
 
 
626 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0119916  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  34.19 
 
 
635 aa  320  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0262  ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 
626 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  33.57 
 
 
632 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0204  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 
626 aa  320  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.26 
 
 
645 aa  316  6e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  36.78 
 
 
567 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0493  ABC transporter related  34.19 
 
 
630 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0243  ABC transporter, ATP-binding protein  36.6 
 
 
626 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.592514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  36.64 
 
 
548 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  32.91 
 
 
641 aa  313  7.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  33.09 
 
 
690 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  34.02 
 
 
646 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  34.85 
 
 
649 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  34.71 
 
 
649 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1237  ABC transporter related  33.21 
 
 
638 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000223212  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  34.23 
 
 
685 aa  309  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  33.45 
 
 
668 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  36.45 
 
 
548 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1642  ABC transporter related  35.26 
 
 
632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0205  ABC transporter related  36.04 
 
 
628 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 
663 aa  307  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  36.45 
 
 
548 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  33.46 
 
 
540 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  32.89 
 
 
541 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  35.85 
 
 
545 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 
663 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  33.89 
 
 
638 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  36.61 
 
 
540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0840  ABC transporter related  36.28 
 
 
540 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.459772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  34.82 
 
 
659 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  36.15 
 
 
540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  36.15 
 
 
540 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  36.15 
 
 
540 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1449  ABC transporter  33.52 
 
 
643 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.174197  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  32.7 
 
 
541 aa  303  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  33.82 
 
 
649 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1721  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
643 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.269264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  34.94 
 
 
545 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01001  ABC transporter, ATP binding component  35.61 
 
 
575 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  31.81 
 
 
536 aa  302  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  33.83 
 
 
620 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0719  ABC transporter related  36.03 
 
 
540 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.363919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  34.91 
 
 
645 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  34.42 
 
 
540 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0941  ATPase  36.24 
 
 
569 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  35.89 
 
 
540 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  35.82 
 
 
564 aa  301  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  32.64 
 
 
659 aa  300  3e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  34.09 
 
 
631 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2319  ATPase  37.9 
 
 
574 aa  300  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  35.11 
 
 
540 aa  299  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  33.58 
 
 
667 aa  299  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  31.73 
 
 
532 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  32.25 
 
 
656 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  35.26 
 
 
540 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  35.77 
 
 
560 aa  298  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  34.67 
 
 
572 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 
532 aa  297  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 
631 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  34.64 
 
 
543 aa  296  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  33.94 
 
 
644 aa  296  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  33.39 
 
 
672 aa  296  8e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 
631 aa  296  9e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.03 
 
 
541 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  31.88 
 
 
658 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 
641 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  34.19 
 
 
645 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  33.57 
 
 
630 aa  294  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.53 
 
 
709 aa  293  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
631 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
631 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  34.49 
 
 
540 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.148831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>