More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4144 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  65.23 
 
 
572 aa  724    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  62.68 
 
 
539 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  65.32 
 
 
571 aa  733    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  61.5 
 
 
536 aa  683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  59.11 
 
 
544 aa  637    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  60.78 
 
 
561 aa  674    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64.83 
 
 
562 aa  746    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  64.82 
 
 
558 aa  673    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  57.73 
 
 
554 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  64.11 
 
 
560 aa  711    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  100 
 
 
560 aa  1138    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  60.36 
 
 
539 aa  664    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  65.77 
 
 
569 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  64.29 
 
 
574 aa  727    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  96.43 
 
 
564 aa  1056    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  57.04 
 
 
559 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  56.25 
 
 
555 aa  628  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  57.63 
 
 
542 aa  617  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  57.7 
 
 
553 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  57.96 
 
 
543 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
488 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30.86 
 
 
540 aa  204  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  31 
 
 
540 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  31.31 
 
 
549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  31.2 
 
 
620 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.12 
 
 
544 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  29.69 
 
 
543 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  27.83 
 
 
643 aa  195  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  30.92 
 
 
621 aa  194  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  32.6 
 
 
615 aa  193  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  30.92 
 
 
621 aa  193  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  28.52 
 
 
668 aa  193  6e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  32.17 
 
 
627 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  32.29 
 
 
627 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  30.98 
 
 
633 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  30.67 
 
 
634 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  32.53 
 
 
642 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  33.08 
 
 
625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  32.46 
 
 
615 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  32.46 
 
 
615 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  30.29 
 
 
621 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  30.51 
 
 
620 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  26.83 
 
 
621 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  29.4 
 
 
690 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  30.54 
 
 
545 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  31.21 
 
 
543 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  30.07 
 
 
637 aa  187  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  30.09 
 
 
659 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  31.53 
 
 
645 aa  186  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 
632 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  31.94 
 
 
627 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4779  ABC transporter related  27.7 
 
 
646 aa  183  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000154774  hitchhiker  0.00318423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  32.61 
 
 
618 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 
631 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  27 
 
 
631 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  27 
 
 
631 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  28.78 
 
 
653 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  25.93 
 
 
639 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  28.28 
 
 
631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  28.31 
 
 
649 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  25.99 
 
 
630 aa  181  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  35.19 
 
 
691 aa  181  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 
631 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4285  ABC transporter related protein  28.26 
 
 
656 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833629  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 
631 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 
631 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  30.73 
 
 
528 aa  180  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.66 
 
 
641 aa  180  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  26.58 
 
 
622 aa  180  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 
631 aa  180  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  32.36 
 
 
615 aa  179  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  29.03 
 
 
640 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2240  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.75 
 
 
551 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.497585 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0587  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.75 
 
 
551 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  28.96 
 
 
545 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  29.57 
 
 
640 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  26.39 
 
 
620 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  30.48 
 
 
629 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0373  ABC transporter related  30.71 
 
 
657 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  27.87 
 
 
636 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  29.57 
 
 
540 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  27.87 
 
 
647 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  30.85 
 
 
622 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 
627 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.42 
 
 
639 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  31.27 
 
 
656 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  31.65 
 
 
560 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  26.64 
 
 
631 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  27.83 
 
 
632 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  28.35 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  28.35 
 
 
625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 
631 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  29.19 
 
 
623 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0800  ABC transporter, ATP-binding protein  25.76 
 
 
622 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285677 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  28.7 
 
 
653 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  29.89 
 
 
656 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  29.61 
 
 
540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  27.88 
 
 
575 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  30.83 
 
 
565 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2071  ABC transporter related  31.09 
 
 
656 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.144058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>