More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9185 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  100 
 
 
536 aa  1092    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  64.81 
 
 
539 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  62.43 
 
 
572 aa  664    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  65.37 
 
 
544 aa  696    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  62.08 
 
 
569 aa  668    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  58.48 
 
 
555 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  68.15 
 
 
539 aa  715    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  62.45 
 
 
553 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  59.5 
 
 
562 aa  662    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  61.5 
 
 
560 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  63.88 
 
 
561 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  62.39 
 
 
564 aa  651    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  64.04 
 
 
574 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  69.19 
 
 
543 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  60.04 
 
 
554 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  60.93 
 
 
542 aa  629  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  58.57 
 
 
571 aa  625  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  59.15 
 
 
559 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  59.71 
 
 
560 aa  620  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  61.36 
 
 
558 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
488 aa  345  8.999999999999999e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  32.04 
 
 
668 aa  225  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  31.56 
 
 
767 aa  221  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  32.52 
 
 
645 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  32.33 
 
 
690 aa  218  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  32.39 
 
 
649 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  31.01 
 
 
545 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  30.45 
 
 
636 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.1 
 
 
645 aa  212  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  31.12 
 
 
649 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  32.23 
 
 
709 aa  210  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  32.82 
 
 
645 aa  209  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  31.1 
 
 
621 aa  209  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 
545 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.9 
 
 
543 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  31.52 
 
 
544 aa  207  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  31.12 
 
 
627 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  31.24 
 
 
627 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  31.37 
 
 
540 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.05 
 
 
643 aa  205  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  31.57 
 
 
540 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  28.9 
 
 
637 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  31.3 
 
 
543 aa  203  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  29.08 
 
 
639 aa  203  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0628  ABC transporter related  31.13 
 
 
567 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0261051  normal  0.0724506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  30.89 
 
 
620 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0701  ABC transporter related  32.72 
 
 
648 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000286992 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  32.48 
 
 
615 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01715  ABC transporter ATP-binding protein  29.54 
 
 
643 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.891817  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  30.68 
 
 
621 aa  200  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0690  ABC transporter related protein  32.64 
 
 
648 aa  200  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.185815  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  30.5 
 
 
621 aa  200  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  30.77 
 
 
640 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  29.59 
 
 
575 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  32.25 
 
 
656 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  28.96 
 
 
634 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  32.6 
 
 
620 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  29.96 
 
 
581 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14680  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  33.4 
 
 
534 aa  197  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.68 
 
 
659 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2545  ABC transporter-related protein  31.41 
 
 
641 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00131859  decreased coverage  1.5432e-19 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  31.46 
 
 
625 aa  197  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  30.95 
 
 
672 aa  197  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  31.23 
 
 
549 aa  196  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  30.24 
 
 
636 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0493  ATPase  30.19 
 
 
653 aa  196  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.521292  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0840  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.71 
 
 
553 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  28.65 
 
 
649 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  28.82 
 
 
540 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 
533 aa  195  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.87 
 
 
557 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  29.12 
 
 
540 aa  194  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  29.01 
 
 
641 aa  194  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2563  ABC transporter related  32.01 
 
 
532 aa  194  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  30.28 
 
 
637 aa  194  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.87 
 
 
557 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  28.11 
 
 
638 aa  194  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  31.81 
 
 
629 aa  193  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.89 
 
 
639 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  27.98 
 
 
634 aa  193  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  35.18 
 
 
691 aa  192  9e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0618  ABC transporter related  31.24 
 
 
652 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000236816  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  28.72 
 
 
625 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0135  ABC transporter related  31.86 
 
 
540 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.216593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  28.98 
 
 
564 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  28.72 
 
 
625 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  30.98 
 
 
633 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  30.59 
 
 
540 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  27.68 
 
 
622 aa  192  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0192  ABC transporter related  31.86 
 
 
540 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.566668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0224  ABC transporter related  31.82 
 
 
540 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  29.53 
 
 
664 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  29.96 
 
 
651 aa  192  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2551  ABC transporter-like protein protein  30.04 
 
 
564 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  30 
 
 
548 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  29.73 
 
 
545 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  33.33 
 
 
613 aa  192  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60800  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 
554 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  29.62 
 
 
540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  30.76 
 
 
623 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>