More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0882 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  62.54 
 
 		 539 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  63.83 
 
 		 569 aa  702    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  67.42 
 
 		 558 aa  669    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  61.74 
 
 		 559 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  64.11 
 
 		 564 aa  682    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  65.56 
 
 		 561 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  62.54 
 
 		 571 aa  687    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  62.87 
 
 		 544 aa  651    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  59.76 
 
 		 555 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  64.04 
 
 		 536 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  66.08 
 
 		 572 aa  715    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  64.29 
 
 		 539 aa  658    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  64.29 
 
 		 560 aa  708    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  61.39 
 
 		 554 aa  671    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64.98 
 
 		 562 aa  712    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  100 
 
 		 574 aa  1154    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  62.2 
 
 		 560 aa  672    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  58.74 
 
 		 553 aa  613  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  61.05 
 
 		 543 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  57.87 
 
 		 542 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  41.82 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.44 
 
 		 668 aa  210  7e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  30.6 
 
 		 690 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  28.39 
 
 		 643 aa  195  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.85 
 
 		 544 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.06 
 
 		 545 aa  193  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  29.61 
 
 		 620 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.25 
 
 		 545 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  30.78 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  29.84 
 
 		 649 aa  189  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  27.16 
 
 		 622 aa  190  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  35.22 
 
 		 691 aa  189  9e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 540 aa  187  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  27.56 
 
 		 653 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  26.54 
 
 		 621 aa  187  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  30.23 
 
 		 543 aa  187  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  29.75 
 
 		 549 aa  186  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  27.21 
 
 		 637 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  31 
 
 		 540 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  28.92 
 
 		 645 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  30.47 
 
 		 709 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  28.37 
 
 		 575 aa  186  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  28.39 
 
 		 625 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  28.39 
 
 		 625 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  29.58 
 
 		 659 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  28.11 
 
 		 632 aa  183  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  31.36 
 
 		 560 aa  183  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.36 
 
 		 767 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.01 
 
 		 636 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  28.99 
 
 		 645 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.71 
 
 		 641 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  29.65 
 
 		 530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1467  ABC transporter related  27.85 
 
 		 639 aa  181  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  28.05 
 
 		 637 aa  181  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  30.5 
 
 		 540 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  26.64 
 
 		 634 aa  181  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  27.44 
 
 		 630 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  31.12 
 
 		 565 aa  180  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  26.41 
 
 		 627 aa  179  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.59 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  28.92 
 
 		 620 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 636 aa  178  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  30.68 
 
 		 533 aa  178  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  28.88 
 
 		 581 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  33.15 
 
 		 613 aa  178  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  24.96 
 
 		 620 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  28.73 
 
 		 688 aa  178  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  30.23 
 
 		 542 aa  178  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0758  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.01 
 
 		 557 aa  177  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  29.38 
 
 		 564 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  31.08 
 
 		 644 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  29.47 
 
 		 627 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  27.1 
 
 		 629 aa  177  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  29.6 
 
 		 627 aa  177  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  30.2 
 
 		 540 aa  176  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  30.09 
 
 		 540 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  29.31 
 
 		 530 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  27.16 
 
 		 627 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  30.28 
 
 		 533 aa  176  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.54 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0740  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.83 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  28.6 
 
 		 672 aa  175  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  28.99 
 
 		 621 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  28.95 
 
 		 530 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  26.84 
 
 		 639 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  28.95 
 
 		 530 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  27.46 
 
 		 631 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  28.4 
 
 		 621 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  27.13 
 
 		 650 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4945  ABC transporter related  28.19 
 
 		 561 aa  173  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  28.4 
 
 		 621 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  29.29 
 
 		 629 aa  173  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  27.73 
 
 		 634 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  28.4 
 
 		 659 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  27.19 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  27.17 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0877  ABC transporter related protein  28.89 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  26.65 
 
 		 632 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 629 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  27.46 
 
 		 631 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>