More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0525 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  63.41 
 
 		 562 aa  694    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  64.46 
 
 		 564 aa  698    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  67.2 
 
 		 572 aa  717    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  64.97 
 
 		 571 aa  714    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  62.21 
 
 		 561 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  66.13 
 
 		 569 aa  711    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  100 
 
 		 560 aa  1119    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  64.11 
 
 		 560 aa  709    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  62.2 
 
 		 574 aa  683    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  64.46 
 
 		 558 aa  632  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  60.54 
 
 		 544 aa  629  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  59.71 
 
 		 536 aa  631  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  61.96 
 
 		 539 aa  628  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  58.06 
 
 		 554 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  59.46 
 
 		 539 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  55.97 
 
 		 555 aa  592  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  57.5 
 
 		 542 aa  591  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  57.5 
 
 		 559 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  58.57 
 
 		 543 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  54.12 
 
 		 553 aa  538  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 488 aa  364  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  31.14 
 
 		 668 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  28.86 
 
 		 632 aa  205  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  31.57 
 
 		 767 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.39 
 
 		 643 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  27.96 
 
 		 622 aa  202  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.54 
 
 		 620 aa  200  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  30.42 
 
 		 631 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  30.77 
 
 		 540 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  30.59 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 631 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  30.15 
 
 		 690 aa  194  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 		 631 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 		 631 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  28.81 
 
 		 630 aa  193  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 631 aa  193  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 545 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  29.15 
 
 		 632 aa  192  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  30.39 
 
 		 544 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 631 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  29.58 
 
 		 564 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  30.7 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 631 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 631 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  29.55 
 
 		 664 aa  190  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  29.77 
 
 		 709 aa  189  8e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 629 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  28.24 
 
 		 630 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  30.97 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  29.33 
 
 		 630 aa  188  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  30.76 
 
 		 575 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  28.07 
 
 		 653 aa  188  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2115  ABC transporter related  27.47 
 
 		 621 aa  187  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0255573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  28.96 
 
 		 631 aa  187  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  29.55 
 
 		 631 aa  186  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  26.44 
 
 		 666 aa  186  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  27.62 
 
 		 639 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3277  ABC transporter related  32.65 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  29.87 
 
 		 672 aa  184  3e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  30.04 
 
 		 581 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  28.88 
 
 		 631 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  29.87 
 
 		 649 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  29.27 
 
 		 645 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  29.66 
 
 		 540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  27.3 
 
 		 644 aa  183  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  30.07 
 
 		 631 aa  183  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  30.55 
 
 		 540 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  25.9 
 
 		 634 aa  183  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  27.06 
 
 		 629 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  31.58 
 
 		 633 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  30.92 
 
 		 649 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  31.2 
 
 		 545 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  26.95 
 
 		 627 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4996  ABC transporter related  26.3 
 
 		 620 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  27.31 
 
 		 613 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.29 
 
 		 641 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 		 627 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1403  ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 667 aa  180  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  36.15 
 
 		 691 aa  179  8e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  29.55 
 
 		 636 aa  179  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  29.74 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11540  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  30.46 
 
 		 532 aa  179  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00577413  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  30.73 
 
 		 662 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  27.63 
 
 		 642 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  27.02 
 
 		 544 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.37 
 
 		 545 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0136  ABC transporter, ATP-binding protein  27.79 
 
 		 518 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.997167  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  27.63 
 
 		 642 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0453  ABC transporter related protein  29.26 
 
 		 552 aa  178  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0136  ABC transporter ATPase  27.79 
 
 		 518 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  30.67 
 
 		 560 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6901  ABC transporter, ATP-binding protein  33.7 
 
 		 545 aa  177  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1799  ABC transporter related protein  29.11 
 
 		 638 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0949  ABC transporter related  30.89 
 
 		 540 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  26.87 
 
 		 632 aa  177  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49454  ABC(ATP-binding) family transporter  29.85 
 
 		 649 aa  176  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00209815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 		 540 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  29.58 
 
 		 667 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01571  ABC transporter, ATP binding component  29.62 
 
 		 572 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  28.73 
 
 		 636 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>