More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0719 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29380  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  65.48 
 
 		 562 aa  723    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1325  ABC transporter related  65.19 
 
 		 572 aa  720    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0525  ABC transporter related  66.19 
 
 		 560 aa  703    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3918  ABC transporter related  66.31 
 
 		 564 aa  708    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0719  ABC transporter related  100 
 
 		 569 aa  1122    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02910  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  65.03 
 
 		 571 aa  712    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9185  ABC transporter related protein  62.14 
 
 		 536 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0902  ABC transporter related protein  60.29 
 
 		 555 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103036  normal  0.118594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3891  ABC transporter related  62.59 
 
 		 554 aa  666    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4282  ABC transporter related  62.57 
 
 		 559 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184754  hitchhiker  0.00727726 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2614  ABC transporter related protein  67.44 
 
 		 558 aa  682    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1338  ABC transporter related protein  63.69 
 
 		 539 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4144  ABC transporter related  65.77 
 
 		 560 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0938  ABC transporter related protein  65.12 
 
 		 539 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2749  ABC transporter related protein  67.91 
 
 		 561 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.308133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0882  ABC transporter related  63.83 
 
 		 574 aa  703    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1465  ABC transporter related protein  62.43 
 
 		 544 aa  628  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1583  ABC transporter related  61.72 
 
 		 542 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7235  ABC transporter related protein  63.17 
 
 		 543 aa  611  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602341  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0969  ABC transporter related  58.33 
 
 		 553 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.350056  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0413  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.630834  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1322  ABC transporter related  31.44 
 
 		 690 aa  210  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.225947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  31.13 
 
 		 709 aa  206  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  33.4 
 
 		 620 aa  203  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.61 
 
 		 643 aa  202  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  32.09 
 
 		 540 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  30.34 
 
 		 668 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.6 
 
 		 649 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2173  ABC-type transport system, ATPase component  32.17 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2093  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 545 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.206027  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  31.57 
 
 		 672 aa  193  8e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4025  ABC transporter related  29.92 
 
 		 543 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000600083  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0024  ABC transporter related protein  27.17 
 
 		 627 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  31.05 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  27.84 
 
 		 622 aa  191  4e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  31.16 
 
 		 540 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5994  ABC transporter related  31.87 
 
 		 540 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1247  ABC transporter related  29.53 
 
 		 645 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  29.74 
 
 		 544 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  29.66 
 
 		 631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1432  ABC transporter related  30.11 
 
 		 636 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  26.48 
 
 		 639 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  28.94 
 
 		 630 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3628  ABC transporter related  30.53 
 
 		 649 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00303453  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.11 
 
 		 767 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.8 
 
 		 641 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  29.36 
 
 		 631 aa  183  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 		 631 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  28.94 
 
 		 653 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  29.58 
 
 		 631 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  29.48 
 
 		 631 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  33.09 
 
 		 548 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1721  ABC transporter-related protein  32.77 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 		 631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 		 631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  31.75 
 
 		 565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5912  ABC transporter related  31.93 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.214443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  31.7 
 
 		 633 aa  181  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  31 
 
 		 540 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  30.7 
 
 		 659 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.55 
 
 		 659 aa  180  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1792  ABC transporter related  32.59 
 
 		 548 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 		 631 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0878  ABC transporter component  31.91 
 
 		 540 aa  179  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  29.66 
 
 		 542 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 		 631 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1631  ABC transporter related  32.2 
 
 		 545 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.987433 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0407  ABC transporter related  27.48 
 
 		 634 aa  177  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.499009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4586  ABC transporter, ATPase subunit  30.02 
 
 		 545 aa  177  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  30.82 
 
 		 621 aa  176  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7527  hypothetical protein  34.3 
 
 		 536 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2293  ABC transporter related  33.14 
 
 		 613 aa  176  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0922  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 		 645 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0308249  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2121  ABC transporter related  29.43 
 
 		 642 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000290627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2084  ABC transporter related  29.43 
 
 		 642 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00913447  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  30.82 
 
 		 621 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  30.46 
 
 		 621 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  29.38 
 
 		 631 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2216  ABC transporter, ATP-binding protein  27.37 
 
 		 632 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.812248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  30.74 
 
 		 620 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2860  ABC transporter related  32.49 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  29.49 
 
 		 631 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1658  ABC transporter, ATP-binding protein  28.1 
 
 		 644 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0768628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  27.1 
 
 		 613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0334  ATPase  29.42 
 
 		 656 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0415  ABC transporter ATPase  29.68 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.238248  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4079  ABC transporter related  31.57 
 
 		 540 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0601  ABC transporter related  30.11 
 
 		 651 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  29.66 
 
 		 649 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1027  ABC transporter related  28.84 
 
 		 664 aa  174  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  30.67 
 
 		 540 aa  174  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  30.1 
 
 		 541 aa  174  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  29.04 
 
 		 640 aa  173  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0661  ABC transporter-related protein  28.99 
 
 		 650 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  27.99 
 
 		 632 aa  173  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3313  ABC transporter related  27.85 
 
 		 636 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000905191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  30.38 
 
 		 540 aa  173  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  32.14 
 
 		 540 aa  173  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0900  ABC transporter related  26.64 
 
 		 666 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>