More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3303 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  82.02 
 
 		 545 aa  949    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2206  ABC transporter, ATP-binding protein  58.96 
 
 		 538 aa  671    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1592  ABC transporter, ATP-binding protein  59.04 
 
 		 550 aa  678    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.717967  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0962  ABC transporter, ATP-binding protein  60.34 
 
 		 535 aa  673    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.6502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3372  ABC transporter related  62.55 
 
 		 542 aa  726    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000385391  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2988  ABC transporter, ATP-binding protein  64.7 
 
 		 541 aa  737    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000213646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1482  ABC transporter related  59.4 
 
 		 533 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0723  ABC transporter related protein  60.08 
 
 		 539 aa  677    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2013  ABC transporter-related protein  66.04 
 
 		 541 aa  738    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000145808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2738  ABC transporter ATP-binding protein  64.33 
 
 		 541 aa  731    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000394733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2689  ABC transporter, ATP-binding protein  64.7 
 
 		 541 aa  737    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000011561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2667  ABC transporter, ATP-binding protein  64.7 
 
 		 541 aa  736    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000362923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3550  ABC transporter related  82.94 
 
 		 545 aa  950    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000348085  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0227  ABC transporter related  63.69 
 
 		 537 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198546  normal  0.0874322 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1367  ABC transporter related  67.97 
 
 		 538 aa  759    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1852  ABC transporter related protein  61.96 
 
 		 541 aa  700    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2634  ABC-type transport system, ATPase component  77.61 
 
 		 544 aa  893    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2630  ABC transporter-related protein  82.94 
 
 		 545 aa  947    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2948  ABC transporter ATP-binding protein  64.33 
 
 		 541 aa  731    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000544577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2952  ABC transporter, ATP-binding protein  64.51 
 
 		 541 aa  735    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1453  ABC transporter related  59.4 
 
 		 533 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1434  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 543 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.36515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2947  ABC transporter, ATP-binding protein  64.7 
 
 		 541 aa  736    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10459e-43 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0945  ABC transporter related  98.71 
 
 		 544 aa  1108    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000191472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2288  ABC transporter, ATP-binding protein  64.51 
 
 		 541 aa  734    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000589648  hitchhiker  1.14082e-17 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0766  ABC transporter, ATP-binding protein  61.47 
 
 		 543 aa  692    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1560  ABC transporter related  61.67 
 
 		 554 aa  707    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3011  ABC transporter related  82.02 
 
 		 545 aa  943    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00994639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3303  ABC transporter related protein  100 
 
 		 544 aa  1122    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1448  ABC transporter related  57.43 
 
 		 541 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3458  ABC transporter, ATP-binding protein  57.46 
 
 		 538 aa  666    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0161229 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1757  ABC transporter, ATP-binding protein  63.57 
 
 		 527 aa  692    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000447587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1487  ABC transporter  63.38 
 
 		 527 aa  691    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2994  ABC transporter, ATP-binding protein  64.7 
 
 		 541 aa  737    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000223296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6528  ABC transporter related  58.39 
 
 		 548 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1485  ABC transporter related  65.85 
 
 		 537 aa  723    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2949  ABC transporter related  82.57 
 
 		 545 aa  949    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000330729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1915  ABC transporter related  55.76 
 
 		 539 aa  631  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0601871  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4550  ABC transporter related  54.63 
 
 		 539 aa  617  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.767236  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1995  ABC transporter ATPase  55.99 
 
 		 540 aa  616  1e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2171  ABC transporter, ATP-binding protein  55.02 
 
 		 539 aa  611  1e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0650343  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0840  ABC transporter ATPase  53.76 
 
 		 540 aa  610  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11928  ABC transporter, ATP-binding protein  54.28 
 
 		 543 aa  605  9.999999999999999e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680415  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0063  ABC transporter ATPase  53.83 
 
 		 545 aa  591  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1185  ABC transporter ATPase  50.09 
 
 		 540 aa  565  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.909793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  48.68 
 
 		 528 aa  527  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  48.87 
 
 		 528 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  48.68 
 
 		 528 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  48.49 
 
 		 528 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  48.3 
 
 		 528 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.14 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0151  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 530 aa  512  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175992  normal  0.980614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  47.14 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  47.14 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  48.11 
 
 		 528 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 530 aa  509  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1690  ABC transporter, ATP-binding protein  47.71 
 
 		 530 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  48.09 
 
 		 528 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  48.38 
 
 		 531 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  47.45 
 
 		 531 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 		 530 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  46.95 
 
 		 530 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  45.81 
 
 		 557 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 		 531 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2760  ABC transporter related  47.71 
 
 		 546 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 		 530 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  46.37 
 
 		 530 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 		 530 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  47 
 
 		 520 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  47.74 
 
 		 529 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2586  ABC transporter related  47.71 
 
 		 546 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.109376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2653  ABC transporter related  47.52 
 
 		 546 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.498071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  46.33 
 
 		 531 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1366  ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 		 534 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  46.49 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  46.2 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  47.33 
 
 		 546 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  47.32 
 
 		 521 aa  499  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  45.37 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  45.42 
 
 		 530 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  45.61 
 
 		 531 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  46.2 
 
 		 528 aa  495  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2771  ABC transporter related  47.29 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  47.64 
 
 		 529 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.31 
 
 		 530 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.7 
 
 		 521 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 531 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 		 587 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 		 546 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  45.42 
 
 		 531 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  45.95 
 
 		 530 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  45.42 
 
 		 530 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  46.29 
 
 		 530 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>