More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1485 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1915  ABC transporter related  58.7 
 
 		 539 aa  669    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0601871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  64.42 
 
 		 545 aa  730    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3303  ABC transporter related protein  65.85 
 
 		 544 aa  734    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2206  ABC transporter, ATP-binding protein  58.85 
 
 		 538 aa  685    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1592  ABC transporter, ATP-binding protein  60.22 
 
 		 550 aa  696    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.717967  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0962  ABC transporter, ATP-binding protein  65.28 
 
 		 535 aa  705    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.6502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2288  ABC transporter, ATP-binding protein  71.8 
 
 		 541 aa  801    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000589648  hitchhiker  1.14082e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3011  ABC transporter related  65.73 
 
 		 545 aa  738    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00994639  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0766  ABC transporter, ATP-binding protein  59.03 
 
 		 543 aa  679    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2988  ABC transporter, ATP-binding protein  72.17 
 
 		 541 aa  803    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000213646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2947  ABC transporter, ATP-binding protein  71.61 
 
 		 541 aa  800    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10459e-43 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6528  ABC transporter related  59.41 
 
 		 548 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2171  ABC transporter, ATP-binding protein  60.79 
 
 		 539 aa  679    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0650343  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1995  ABC transporter ATPase  60.56 
 
 		 540 aa  682    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79953  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2738  ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 541 aa  796    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000394733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2689  ABC transporter, ATP-binding protein  71.8 
 
 		 541 aa  801    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000011561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2667  ABC transporter, ATP-binding protein  71.61 
 
 		 541 aa  800    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000362923  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3550  ABC transporter related  66.36 
 
 		 545 aa  748    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000348085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4550  ABC transporter related  56.3 
 
 		 539 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.767236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0840  ABC transporter ATPase  57.86 
 
 		 540 aa  668    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2952  ABC transporter, ATP-binding protein  71.61 
 
 		 541 aa  799    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2634  ABC-type transport system, ATPase component  65.1 
 
 		 544 aa  739    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0227  ABC transporter related  64.31 
 
 		 537 aa  741    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198546  normal  0.0874322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2949  ABC transporter related  64.5 
 
 		 545 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000330729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2630  ABC transporter-related protein  63.94 
 
 		 545 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1485  ABC transporter related  100 
 
 		 537 aa  1100    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2948  ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 541 aa  796    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000544577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0945  ABC transporter related  65.66 
 
 		 544 aa  731    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000191472 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0723  ABC transporter related protein  64.75 
 
 		 539 aa  749    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3372  ABC transporter related  68.28 
 
 		 542 aa  778    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000385391  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1560  ABC transporter related  66.6 
 
 		 554 aa  762    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046751  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11928  ABC transporter, ATP-binding protein  56.48 
 
 		 543 aa  644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1434  ABC transporter related protein  64.44 
 
 		 543 aa  736    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.36515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2013  ABC transporter-related protein  72.54 
 
 		 541 aa  806    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000145808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1367  ABC transporter related  74.35 
 
 		 538 aa  838    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1852  ABC transporter related protein  64.94 
 
 		 541 aa  739    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3458  ABC transporter, ATP-binding protein  62.89 
 
 		 538 aa  731    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0161229 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1757  ABC transporter, ATP-binding protein  68.25 
 
 		 527 aa  733    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000447587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1487  ABC transporter  68.06 
 
 		 527 aa  732    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1482  ABC transporter related  65.28 
 
 		 533 aa  704    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1448  ABC transporter related  62.8 
 
 		 541 aa  705    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2994  ABC transporter, ATP-binding protein  71.99 
 
 		 541 aa  801    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000223296  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0063  ABC transporter ATPase  57.46 
 
 		 545 aa  643    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1453  ABC transporter related  65.28 
 
 		 533 aa  704    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1185  ABC transporter ATPase  54.53 
 
 		 540 aa  617  1e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.909793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  48.77 
 
 		 528 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  49.35 
 
 		 540 aa  541  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0151  ABC transporter, ATP-binding protein  49.14 
 
 		 530 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175992  normal  0.980614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  48.2 
 
 		 528 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  48.02 
 
 		 528 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  48.96 
 
 		 529 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  48.02 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  47.83 
 
 		 528 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  48.02 
 
 		 528 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  48.56 
 
 		 521 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  48.96 
 
 		 530 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 530 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.14 
 
 		 521 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 530 aa  529  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 531 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  46.24 
 
 		 531 aa  526  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 531 aa  525  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  47.48 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  46.24 
 
 		 587 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  49.15 
 
 		 546 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  47.82 
 
 		 528 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  46.7 
 
 		 530 aa  521  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 599 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 555 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  48.68 
 
 		 529 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 555 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 599 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 599 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1690  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 530 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  45.68 
 
 		 531 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  47.1 
 
 		 520 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0472  ABC transporter related  49.54 
 
 		 541 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  46.23 
 
 		 531 aa  515  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  47.53 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  46.14 
 
 		 546 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.23 
 
 		 531 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  46.14 
 
 		 531 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  46.33 
 
 		 530 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  46.14 
 
 		 530 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  45.57 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2760  ABC transporter related  45.95 
 
 		 546 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  47.07 
 
 		 599 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2525  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 		 533 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 521 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3311  ABC transporter related  46.4 
 
 		 527 aa  513  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  45.57 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 530 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 		 530 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2586  ABC transporter related  45.95 
 
 		 546 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.109376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2653  ABC transporter related  45.76 
 
 		 546 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.498071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>