More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0063 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0962  ABC transporter, ATP-binding protein  64.37 
 
 		 535 aa  679    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.6502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2988  ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 541 aa  707    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000213646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3372  ABC transporter related  57.2 
 
 		 542 aa  647    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000385391  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2171  ABC transporter, ATP-binding protein  76.06 
 
 		 539 aa  853    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0650343  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2952  ABC transporter, ATP-binding protein  63.6 
 
 		 541 aa  705    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2013  ABC transporter-related protein  64.1 
 
 		 541 aa  711    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000145808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2738  ABC transporter ATP-binding protein  63.42 
 
 		 541 aa  704    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000394733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2689  ABC transporter, ATP-binding protein  63.6 
 
 		 541 aa  706    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000011561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2667  ABC transporter, ATP-binding protein  63.42 
 
 		 541 aa  705    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000362923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2288  ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 541 aa  706    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000589648  hitchhiker  1.14082e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2948  ABC transporter ATP-binding protein  63.42 
 
 		 541 aa  704    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000544577  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1852  ABC transporter related protein  57.22 
 
 		 541 aa  648    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2994  ABC transporter, ATP-binding protein  63.79 
 
 		 541 aa  706    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000223296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1995  ABC transporter ATPase  74.68 
 
 		 540 aa  840    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1560  ABC transporter related  59.33 
 
 		 554 aa  667    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046751  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1482  ABC transporter related  64.75 
 
 		 533 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1757  ABC transporter, ATP-binding protein  60.6 
 
 		 527 aa  641    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000447587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1487  ABC transporter  60.41 
 
 		 527 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1367  ABC transporter related  58.17 
 
 		 538 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2947  ABC transporter, ATP-binding protein  63.42 
 
 		 541 aa  705    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10459e-43 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0063  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 545 aa  1118    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0840  ABC transporter ATPase  59.38 
 
 		 540 aa  682    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1185  ABC transporter ATPase  56.62 
 
 		 540 aa  641    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.909793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1453  ABC transporter related  64.75 
 
 		 533 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1485  ABC transporter related  57.46 
 
 		 537 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0227  ABC transporter related  55.6 
 
 		 537 aa  630  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198546  normal  0.0874322 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0723  ABC transporter related protein  55.05 
 
 		 539 aa  627  1e-178  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3458  ABC transporter, ATP-binding protein  55.76 
 
 		 538 aa  623  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0161229 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3550  ABC transporter related  55.06 
 
 		 545 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000348085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1434  ABC transporter related protein  55.68 
 
 		 543 aa  618  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.36515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2630  ABC transporter-related protein  53.96 
 
 		 545 aa  609  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1915  ABC transporter related  54.14 
 
 		 539 aa  610  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0601871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  54.28 
 
 		 545 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4550  ABC transporter related  52.85 
 
 		 539 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.767236  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0766  ABC transporter, ATP-binding protein  53.94 
 
 		 543 aa  608  9.999999999999999e-173  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11928  ABC transporter, ATP-binding protein  54.78 
 
 		 543 aa  604  1.0000000000000001e-171  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2949  ABC transporter related  52.49 
 
 		 545 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000330729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2634  ABC-type transport system, ATPase component  53.79 
 
 		 544 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6528  ABC transporter related  52.47 
 
 		 548 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_002950  PG2206  ABC transporter, ATP-binding protein  52.57 
 
 		 538 aa  593  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1448  ABC transporter related  53.11 
 
 		 541 aa  593  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3303  ABC transporter related protein  53.83 
 
 		 544 aa  591  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0945  ABC transporter related  53.46 
 
 		 544 aa  588  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000191472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3011  ABC transporter related  52.58 
 
 		 545 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00994639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1592  ABC transporter, ATP-binding protein  51.54 
 
 		 550 aa  588  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.717967  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0151  ABC transporter, ATP-binding protein  50.75 
 
 		 530 aa  545  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175992  normal  0.980614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  49.62 
 
 		 531 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  48.32 
 
 		 530 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1285  ABC transporter related  48.13 
 
 		 530 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143824  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf877  ABC transporter ATP-binding protein  51.45 
 
 		 537 aa  528  1e-149  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2315  ABC transporter related  47.95 
 
 		 530 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0855999 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 599 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 599 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  47.57 
 
 		 530 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 555 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 599 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0820  ABC transporter related  49.33 
 
 		 527 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.354226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  47.57 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  47.39 
 
 		 555 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  47.43 
 
 		 540 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  47.55 
 
 		 599 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  48.11 
 
 		 530 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  47.17 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  47.36 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  47.36 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  47.36 
 
 		 530 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5068  ABC transporter, fused ATPase subunits  46.98 
 
 		 530 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.882741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  47.03 
 
 		 531 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1844  ABC transporter related  46.84 
 
 		 540 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  46.54 
 
 		 528 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  46.73 
 
 		 557 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  46.55 
 
 		 531 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1333  ABC transporter related  46.22 
 
 		 560 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858749  normal  0.306045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1398  ABC transporter related  46.22 
 
 		 540 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677597  normal  0.0543543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1681  ABC transporter related  47.32 
 
 		 522 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  46.17 
 
 		 528 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1453  ABC transporter ATP-binding protein  46.78 
 
 		 540 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657517  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  46.17 
 
 		 529 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  46.17 
 
 		 528 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 		 531 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  46.17 
 
 		 528 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  46.98 
 
 		 528 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  45.98 
 
 		 528 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  46.97 
 
 		 520 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1575  ABC transporter-related protein  45.57 
 
 		 540 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.830365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.99 
 
 		 546 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  45.09 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1690  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 530 aa  499  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  45.09 
 
 		 530 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2760  ABC transporter related  46.14 
 
 		 546 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  45.44 
 
 		 546 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2586  ABC transporter related  46.14 
 
 		 546 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.109376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2653  ABC transporter related  45.95 
 
 		 546 aa  498  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.498071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.68 
 
 		 521 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  44.51 
 
 		 530 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  44.51 
 
 		 530 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  44.88 
 
 		 531 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  44.69 
 
 		 531 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  44.51 
 
 		 530 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  44.51 
 
 		 530 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>