More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf877 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf877  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
537 aa  1099    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0840  ABC transporter ATPase  50.38 
 
 
540 aa  532  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020562  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0063  ABC transporter ATPase  51.45 
 
 
545 aa  528  1e-149  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1995  ABC transporter ATPase  51.74 
 
 
540 aa  525  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1448  ABC transporter related  50.48 
 
 
541 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126465  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2171  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 
539 aa  520  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0650343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0962  ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 
535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.6502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1453  ABC transporter related  50.19 
 
 
533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1434  ABC transporter related protein  48.85 
 
 
543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.36515 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1482  ABC transporter related  50.19 
 
 
533 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2994  ABC transporter, ATP-binding protein  50.48 
 
 
541 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000223296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2988  ABC transporter, ATP-binding protein  50.48 
 
 
541 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000213646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2013  ABC transporter-related protein  49.9 
 
 
541 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000145808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1560  ABC transporter related  48.18 
 
 
554 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046751  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2952  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
541 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2947  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
541 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10459e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2738  ABC transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 
541 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000394733  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2689  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
541 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000011561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2667  ABC transporter, ATP-binding protein  50.1 
 
 
541 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000362923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2948  ABC transporter ATP-binding protein  50.1 
 
 
541 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000544577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2288  ABC transporter, ATP-binding protein  49.9 
 
 
541 aa  511  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000589648  hitchhiker  1.14082e-17 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1852  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
541 aa  504  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1915  ABC transporter related  48.21 
 
 
539 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0601871  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1185  ABC transporter ATPase  47.88 
 
 
540 aa  500  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.909793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1485  ABC transporter related  47.69 
 
 
537 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0723  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4550  ABC transporter related  46.89 
 
 
539 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.767236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0227  ABC transporter related  46.24 
 
 
537 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198546  normal  0.0874322 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6528  ABC transporter related  47.5 
 
 
548 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3372  ABC transporter related  46.91 
 
 
542 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000385391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0945  ABC transporter related  47.1 
 
 
544 aa  482  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000191472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2949  ABC transporter related  46.14 
 
 
545 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000330729  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3458  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 
538 aa  482  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0161229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3303  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
544 aa  483  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3011  ABC transporter related  45.95 
 
 
545 aa  479  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00994639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1367  ABC transporter related  47.12 
 
 
538 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1592  ABC transporter, ATP-binding protein  45.32 
 
 
550 aa  478  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.717967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2634  ABC-type transport system, ATPase component  45.56 
 
 
544 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285179  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2630  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 
545 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104931  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11928  ABC transporter, ATP-binding protein  46.14 
 
 
543 aa  476  1e-133  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680415  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0766  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 
543 aa  475  1e-133  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1757  ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 
527 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000447587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1487  ABC transporter  46.92 
 
 
527 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3550  ABC transporter related  44.7 
 
 
545 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000348085  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2206  ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
545 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  41.42 
 
 
528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  41.23 
 
 
528 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.54 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  42.54 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  42.35 
 
 
530 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  42.54 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  42.54 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  42.02 
 
 
521 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 
530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 
528 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  39.93 
 
 
528 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  40.11 
 
 
528 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  39.74 
 
 
528 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  40.37 
 
 
540 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0151  ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 
530 aa  442  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175992  normal  0.980614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  40.41 
 
 
528 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  40.86 
 
 
529 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  40.87 
 
 
529 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  41.42 
 
 
530 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 
531 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  40.67 
 
 
529 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 
531 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  39.89 
 
 
557 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 
530 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  41.04 
 
 
530 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
530 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  41.79 
 
 
530 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  41.06 
 
 
521 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1285  ABC transporter related  41.08 
 
 
530 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143824  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  41.45 
 
 
531 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  40.52 
 
 
530 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  40.67 
 
 
530 aa  435  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
530 aa  433  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 
531 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  40.3 
 
 
531 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 
521 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 
530 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  40.15 
 
 
555 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5068  ABC transporter, fused ATPase subunits  40.33 
 
 
530 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.882741  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  40.49 
 
 
531 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 
555 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  41.44 
 
 
522 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 
530 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  40.89 
 
 
530 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 
587 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  40.71 
 
 
530 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  40.71 
 
 
530 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  40.71 
 
 
530 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  41.04 
 
 
531 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 
599 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.43 
 
 
531 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>