More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6528 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2013  ABC transporter-related protein  59.33 
 
 		 541 aa  686    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000145808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  58.7 
 
 		 545 aa  673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4550  ABC transporter related  60.44 
 
 		 539 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.767236  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2206  ABC transporter, ATP-binding protein  61.14 
 
 		 538 aa  709    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1592  ABC transporter, ATP-binding protein  56.62 
 
 		 550 aa  663    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.717967  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0766  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 		 543 aa  645    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2952  ABC transporter, ATP-binding protein  58.6 
 
 		 541 aa  681    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2988  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 541 aa  682    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000213646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2738  ABC transporter ATP-binding protein  58.6 
 
 		 541 aa  679    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000394733  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11928  ABC transporter, ATP-binding protein  59.04 
 
 		 543 aa  676    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.680415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2689  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 541 aa  683    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000011561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2667  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 541 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000362923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3303  ABC transporter related protein  58.39 
 
 		 544 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2947  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 541 aa  682    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10459e-43 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0945  ABC transporter related  58.21 
 
 		 544 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000191472 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1367  ABC transporter related  62.85 
 
 		 538 aa  715    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1852  ABC transporter related protein  59.74 
 
 		 541 aa  681    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0723  ABC transporter related protein  56.64 
 
 		 539 aa  659    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2634  ABC-type transport system, ATPase component  58.23 
 
 		 544 aa  681    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285179  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3550  ABC transporter related  57.86 
 
 		 545 aa  664    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000348085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2630  ABC transporter-related protein  56.39 
 
 		 545 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2948  ABC transporter ATP-binding protein  58.6 
 
 		 541 aa  679    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000544577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2949  ABC transporter related  58.04 
 
 		 545 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000330729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2994  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 541 aa  682    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000223296  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1560  ABC transporter related  58.33 
 
 		 554 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3372  ABC transporter related  57.06 
 
 		 542 aa  668    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000385391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1485  ABC transporter related  59.41 
 
 		 537 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2288  ABC transporter, ATP-binding protein  58.78 
 
 		 541 aa  683    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000589648  hitchhiker  1.14082e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3458  ABC transporter, ATP-binding protein  60.52 
 
 		 538 aa  728    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0161229 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1757  ABC transporter, ATP-binding protein  59.36 
 
 		 527 aa  654    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000447587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1487  ABC transporter  59.17 
 
 		 527 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.152946  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1448  ABC transporter related  60.29 
 
 		 541 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.126465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6528  ABC transporter related  100 
 
 		 548 aa  1130    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0860258 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1915  ABC transporter related  61.51 
 
 		 539 aa  703    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0601871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1434  ABC transporter related protein  63.14 
 
 		 543 aa  724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.36515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0227  ABC transporter related  62.36 
 
 		 537 aa  713    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198546  normal  0.0874322 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3011  ABC transporter related  57.59 
 
 		 545 aa  668    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00994639  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0962  ABC transporter, ATP-binding protein  55.09 
 
 		 535 aa  620  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.6502  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0840  ABC transporter ATPase  54.06 
 
 		 540 aa  620  1e-176  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.020562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1482  ABC transporter related  54.15 
 
 		 533 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1453  ABC transporter related  54.15 
 
 		 533 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2171  ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 		 539 aa  598  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0650343  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0063  ABC transporter ATPase  52.47 
 
 		 545 aa  595  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1995  ABC transporter ATPase  52.21 
 
 		 540 aa  592  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.79953  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1185  ABC transporter ATPase  52.4 
 
 		 540 aa  590  1e-167  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.909793  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  44.32 
 
 		 528 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  44.51 
 
 		 528 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 528 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  44.32 
 
 		 528 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  43.53 
 
 		 528 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3311  ABC transporter related  44.8 
 
 		 527 aa  491  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf877  ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 		 537 aa  491  1e-137  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 530 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  44.05 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 530 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  44.89 
 
 		 529 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  43.94 
 
 		 528 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  42.16 
 
 		 530 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.8 
 
 		 531 aa  479  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1961  ABC transporter related  44.42 
 
 		 534 aa  480  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  44.34 
 
 		 530 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4180  ABC transporter related  43.13 
 
 		 534 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0101186  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2288  ABC transporter related  43.29 
 
 		 536 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 531 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2084  ABC transporter related  43.4 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1891  ABC transporter related  43.4 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1839  ABC transporter related  43.67 
 
 		 536 aa  478  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2209  ABC transporter related  43.4 
 
 		 530 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2525  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 		 587 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  43.61 
 
 		 528 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  44.42 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  42.62 
 
 		 531 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.1 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  43.48 
 
 		 530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1366  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 534 aa  468  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  43.1 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0151  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175992  normal  0.980614 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  43.1 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  42.42 
 
 		 529 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2370  ABC transporter related  42.72 
 
 		 536 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  42.99 
 
 		 531 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  42.64 
 
 		 528 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  43.87 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 		 530 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 530 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2115  ABC transporter ATPase  41.21 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.199216  normal  0.196946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 		 521 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2108  ABC transporter related  43.29 
 
 		 536 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.020355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  43.04 
 
 		 531 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  42.59 
 
 		 557 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2237  ABC transporter related  43.48 
 
 		 536 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2353  ABC transporter related  43.29 
 
 		 536 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>