More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0627 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0627  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 528 aa  1085    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.261248  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0433  ABC transporter related  49.81 
 
 		 532 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.893812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3988  ABC transporter, ATPase subunit  50.49 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4100  ABC transporter-related protein  50.49 
 
 		 533 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  50.29 
 
 		 533 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3479  ABC transporter, ATPase subunit  49.23 
 
 		 535 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0481507  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  45.12 
 
 		 528 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  44.42 
 
 		 528 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.29 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  43.29 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  43.59 
 
 		 528 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  43.59 
 
 		 528 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 530 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  43.29 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  43.29 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 530 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  43.48 
 
 		 530 aa  444  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  43.21 
 
 		 528 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  43.16 
 
 		 521 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  44.08 
 
 		 528 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  43.59 
 
 		 529 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  43.4 
 
 		 528 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  42.72 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 530 aa  438  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  43.85 
 
 		 522 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  42.96 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  43.48 
 
 		 531 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  43.31 
 
 		 531 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.93 
 
 		 521 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  45 
 
 		 530 aa  438  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  43.4 
 
 		 529 aa  435  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 546 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  43.54 
 
 		 530 aa  434  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  43.07 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  43.78 
 
 		 540 aa  431  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  42.53 
 
 		 531 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1285  ABC transporter related  43.24 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143824  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  43.07 
 
 		 587 aa  428  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  42.88 
 
 		 531 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  42.29 
 
 		 530 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  44.3 
 
 		 530 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  42.16 
 
 		 531 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0151  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 530 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175992  normal  0.980614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  42.1 
 
 		 530 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2315  ABC transporter related  44.11 
 
 		 530 aa  425  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0855999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  42.64 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0820  ABC transporter related  43.83 
 
 		 527 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.354226  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  42.45 
 
 		 546 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  42.66 
 
 		 520 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 530 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1536  ABC transporter related  42.53 
 
 		 530 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 		 530 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1690  ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 		 530 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1506  ABC transporter related  42.88 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2240  ABC transporter related  42.42 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2845  ABC transporter related  42.88 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363602 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1349  ABC transporter related  42.42 
 
 		 522 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1560  ABC transporter related  42.01 
 
 		 554 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1500  ABC transporter related  42.88 
 
 		 522 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130097  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0472  ABC transporter related  42.51 
 
 		 541 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  42.83 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2760  ABC transporter related  41.89 
 
 		 546 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1844  ABC transporter related  41.2 
 
 		 540 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  41.89 
 
 		 531 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  41.95 
 
 		 528 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  43.16 
 
 		 530 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1398  ABC transporter related  41.01 
 
 		 540 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677597  normal  0.0543543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  41.62 
 
 		 520 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1333  ABC transporter related  41.01 
 
 		 560 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858749  normal  0.306045 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2586  ABC transporter related  41.89 
 
 		 546 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.109376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2653  ABC transporter related  41.78 
 
 		 546 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.498071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0169  ABC transporter, ATP-binding protein  42.99 
 
 		 545 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  41.6 
 
 		 526 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 555 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 555 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1575  ABC transporter-related protein  41.57 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.830365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  42.78 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  42.78 
 
 		 530 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1486  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 		 524 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1681  ABC transporter related  43.1 
 
 		 522 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  42.78 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1453  ABC transporter ATP-binding protein  41.2 
 
 		 540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657517  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  41.44 
 
 		 531 aa  409  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2771  ABC transporter related  41.84 
 
 		 522 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  42.59 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  42.59 
 
 		 530 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>