More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3479 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_4100  ABC transporter-related protein  57.74 
 
 
533 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3988  ABC transporter, ATPase subunit  57.74 
 
 
533 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4130  ABC transporter related  57.74 
 
 
533 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3479  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
535 aa  1100    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0481507  normal  0.481436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0433  ABC transporter related  57.77 
 
 
532 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.893812  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  49.15 
 
 
531 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 
531 aa  520  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.83 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  47.65 
 
 
530 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  47.83 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  47.83 
 
 
530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
530 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
530 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  47.65 
 
 
531 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
531 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  47.65 
 
 
530 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
530 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
531 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  48.11 
 
 
528 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  46.89 
 
 
528 aa  511  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 
531 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  47.27 
 
 
530 aa  511  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  47.18 
 
 
530 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 
528 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  47.74 
 
 
528 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  47.74 
 
 
528 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  47.36 
 
 
528 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  46.52 
 
 
530 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  47.09 
 
 
587 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  47.17 
 
 
528 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  47.61 
 
 
520 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  47.09 
 
 
531 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  46.79 
 
 
529 aa  504  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
546 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 
530 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1690  ABC transporter, ATP-binding protein  46.33 
 
 
530 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  46.6 
 
 
529 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  47.42 
 
 
520 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 
522 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2760  ABC transporter related  45.95 
 
 
546 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120146  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  47.08 
 
 
530 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0945  ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 
530 aa  497  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2586  ABC transporter related  45.95 
 
 
546 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.109376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2653  ABC transporter related  45.95 
 
 
546 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.498071  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2240  ABC transporter related  46.46 
 
 
522 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  45.85 
 
 
528 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  45.64 
 
 
531 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1285  ABC transporter related  45.88 
 
 
530 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143824  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0911  ABC transporter ATP-binding protein  46.74 
 
 
523 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  46.79 
 
 
529 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  45.76 
 
 
540 aa  490  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003501  ABC transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 
530 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  45.61 
 
 
557 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 
530 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2315  ABC transporter related  46.05 
 
 
530 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0855999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1349  ABC transporter related  46.85 
 
 
522 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1536  ABC transporter related  45.95 
 
 
530 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1560  ABC transporter related  47.08 
 
 
554 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  46.17 
 
 
521 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  45.95 
 
 
530 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  46.24 
 
 
530 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  45.57 
 
 
546 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.55 
 
 
521 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_002620  TC0627  ABC transporter, ATP-binding protein  49.23 
 
 
528 aa  483  1e-135  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.261248  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1398  ABC transporter related  45.51 
 
 
540 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.677597  normal  0.0543543 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
530 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1844  ABC transporter related  45.88 
 
 
540 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3260  ABC transporter ATP-binding protein, two fused  45.51 
 
 
523 aa  482  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0410854  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  46.05 
 
 
530 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  46.24 
 
 
530 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1333  ABC transporter related  45.51 
 
 
560 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858749  normal  0.306045 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  46.24 
 
 
530 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2845  ABC transporter related  46.08 
 
 
522 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1500  ABC transporter related  46.08 
 
 
522 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  45.86 
 
 
599 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  45.86 
 
 
555 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1486  ABC transporter-related protein  46.27 
 
 
524 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  45.86 
 
 
555 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  45.86 
 
 
599 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1506  ABC transporter related  46.08 
 
 
522 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  46.05 
 
 
530 aa  481  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2771  ABC transporter related  46.08 
 
 
522 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  46.05 
 
 
530 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  45.86 
 
 
599 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  45.86 
 
 
599 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  46.05 
 
 
530 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0820  ABC transporter related  46.56 
 
 
527 aa  477  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.354226  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1367  ABC transporter related  45.83 
 
 
538 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.213728  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  44.84 
 
 
531 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1575  ABC transporter-related protein  45.13 
 
 
540 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.830365  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0472  ABC transporter related  46.24 
 
 
541 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1453  ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
540 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657517  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
521 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5068  ABC transporter, fused ATPase subunits  45.49 
 
 
530 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.882741  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2949  ABC transporter related  45.54 
 
 
545 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000330729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>