More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4011 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4011  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 380 aa  769    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3629  transcription attenuator LytR  88.25 
 
 		 378 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6317  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.55 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  37.54 
 
 		 358 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0942  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.79 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5021  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.67 
 
 		 312 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6384  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.15 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  35.02 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6385  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.27 
 
 		 358 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1681  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.7 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0240426  normal  0.562376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.64 
 
 		 382 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.38 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.01 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 		 486 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  28.25 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.3 
 
 		 522 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.01 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.83 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.28 
 
 		 517 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.19 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.42 
 
 		 307 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.55 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.45 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.61 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.01 
 
 		 496 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.61 
 
 		 643 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.29 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.34 
 
 		 521 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.12 
 
 		 545 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.93 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.48 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  32.59 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  30.7 
 
 		 497 aa  102  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.99 
 
 		 732 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.53 
 
 		 512 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.06 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.07 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.06 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.06 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.11 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.94 
 
 		 625 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.28 
 
 		 493 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.11 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.91 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.44 
 
 		 567 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.91 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.74 
 
 		 497 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.27 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.56 
 
 		 520 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.75 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.87 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.74 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.39 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.8 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  26.46 
 
 		 538 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.8 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  33.98 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.8 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.27 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.22 
 
 		 480 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.33 
 
 		 396 aa  96.3  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.16 
 
 		 573 aa  96.3  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.25 
 
 		 468 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  26.65 
 
 		 530 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.65 
 
 		 493 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.89 
 
 		 453 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.95 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.21 
 
 		 320 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.35 
 
 		 313 aa  93.2  7e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.49 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  26.65 
 
 		 381 aa  92  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.56 
 
 		 509 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.46 
 
 		 619 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  30.71 
 
 		 481 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.73 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.29 
 
 		 584 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.07 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  29.67 
 
 		 307 aa  90.9  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.45 
 
 		 551 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  34.39 
 
 		 296 aa  90.5  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.31 
 
 		 303 aa  90.1  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.24 
 
 		 379 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.71 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  29.37 
 
 		 684 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.66 
 
 		 271 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.56 
 
 		 516 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.93 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.89 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  29.15 
 
 		 505 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.7 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.24 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  27.37 
 
 		 734 aa  88.2  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  24 
 
 		 618 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.27 
 
 		 344 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.05 
 
 		 379 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.82 
 
 		 304 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.09 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.02 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.34 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.865299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>