More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2233 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 
303 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.88 
 
 
419 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.13 
 
 
308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.81 
 
 
319 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 
445 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.07 
 
 
405 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 
411 aa  148  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.73 
 
 
418 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1244  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.17 
 
 
445 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000703915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.11 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.33 
 
 
304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.84 
 
 
453 aa  132  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.45 
 
 
471 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.11 
 
 
302 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.75 
 
 
344 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.62 
 
 
490 aa  125  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.99 
 
 
475 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.02 
 
 
503 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.84 
 
 
426 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.42 
 
 
505 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.87 
 
 
313 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1005  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.08 
 
 
285 aa  122  7e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31 
 
 
303 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31 
 
 
303 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.8 
 
 
443 aa  122  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.51 
 
 
495 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.08 
 
 
414 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.1 
 
 
439 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.19 
 
 
299 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  33.47 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  33.47 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  33.47 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31 
 
 
303 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.47 
 
 
333 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.54 
 
 
492 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  32.64 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0189  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.32 
 
 
403 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.43 
 
 
502 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.66 
 
 
436 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.15 
 
 
492 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  29.81 
 
 
333 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  28.81 
 
 
333 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.76 
 
 
481 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
333 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
335 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  28.81 
 
 
333 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.23 
 
 
304 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.76 
 
 
481 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  29.77 
 
 
335 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  28.81 
 
 
333 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  30.8 
 
 
372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  30.8 
 
 
374 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.35 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  30.1 
 
 
333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.62 
 
 
307 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  32.41 
 
 
329 aa  116  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  29.49 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.85 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  32.22 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.91 
 
 
338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.47 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  32.03 
 
 
471 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.92 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.13 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  33.04 
 
 
472 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.66 
 
 
340 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.33 
 
 
302 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.51 
 
 
383 aa  113  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.49 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.91 
 
 
322 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  29.21 
 
 
340 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.51 
 
 
497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.14 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.04 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.85 
 
 
406 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.56 
 
 
451 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  30.31 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  37.43 
 
 
327 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.43 
 
 
327 aa  109  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  29.93 
 
 
316 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.35 
 
 
404 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.22 
 
 
563 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.92 
 
 
328 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1208  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.55 
 
 
330 aa  107  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000721845  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.91 
 
 
320 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  31.75 
 
 
349 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 
308 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  30.26 
 
 
338 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.97 
 
 
317 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.02 
 
 
512 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.05 
 
 
434 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  29.61 
 
 
337 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  29.28 
 
 
338 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 
380 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  29.28 
 
 
338 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  37.5 
 
 
363 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  29.73 
 
 
337 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>