More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3186 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 451 aa  900    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  54.93 
 
 		 412 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  54.68 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.53 
 
 		 527 aa  239  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1700  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.48 
 
 		 463 aa  230  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1714  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.15 
 
 		 528 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.36 
 
 		 585 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3226  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.07 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.1 
 
 		 353 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.31 
 
 		 505 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.15 
 
 		 503 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.4 
 
 		 356 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1876  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.23 
 
 		 455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000275813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.27 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4851  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.98 
 
 		 432 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.02 
 
 		 497 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.42 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.2 
 
 		 509 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.47 
 
 		 419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.84 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.26 
 
 		 308 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.63 
 
 		 418 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  29.15 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.18 
 
 		 445 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.65 
 
 		 495 aa  113  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.09 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  33.59 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  33.59 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  33.59 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.85 
 
 		 317 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.76 
 
 		 401 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.71 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.99 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  30.37 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  28.72 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  32.81 
 
 		 400 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  28.87 
 
 		 345 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.45 
 
 		 504 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  28.87 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  30 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  30 
 
 		 345 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  30 
 
 		 345 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  30.71 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  30.83 
 
 		 375 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  30.83 
 
 		 375 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  30 
 
 		 345 aa  106  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  30.83 
 
 		 375 aa  106  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 375 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 375 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.83 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  29.07 
 
 		 400 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.98 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  31.23 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.21 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.35 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  31.25 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  31.25 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.25 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  31.25 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  28.67 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  28.62 
 
 		 337 aa  104  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  30.08 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  30.83 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5265  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.6 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  30.43 
 
 		 374 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  30.77 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.26 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  29.7 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.78 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  29.89 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.14 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  29.89 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.75 
 
 		 374 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  32.9 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.35 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  27.96 
 
 		 345 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.51 
 
 		 304 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.94 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  29.74 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  25.97 
 
 		 530 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  29.74 
 
 		 338 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.67 
 
 		 443 aa  99.8  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  32.18 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  32.18 
 
 		 333 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  26.41 
 
 		 481 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.52 
 
 		 643 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  29.37 
 
 		 338 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.12 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.83 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  32.18 
 
 		 338 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.91 
 
 		 409 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>