More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A0946 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  94.25 
 
 
400 aa  719    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  92.25 
 
 
398 aa  692    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  89.75 
 
 
399 aa  693    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  92.5 
 
 
398 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  92.5 
 
 
398 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  92.75 
 
 
398 aa  696    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  91.79 
 
 
399 aa  705    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  92.5 
 
 
398 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  91.52 
 
 
401 aa  737    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  85.52 
 
 
388 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  100 
 
 
400 aa  819    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  65.01 
 
 
345 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  63.37 
 
 
345 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  65.31 
 
 
345 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  66.05 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  66.05 
 
 
345 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  66.05 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  66.67 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  66.05 
 
 
345 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  66.05 
 
 
345 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  65.74 
 
 
345 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  55.1 
 
 
337 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  54.36 
 
 
338 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  53.01 
 
 
338 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  54.39 
 
 
338 aa  356  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  56.05 
 
 
337 aa  353  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  56.05 
 
 
337 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  56.05 
 
 
333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  56.05 
 
 
338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  53.04 
 
 
338 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  52.75 
 
 
337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  55.73 
 
 
337 aa  352  7e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  55.07 
 
 
333 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  54.99 
 
 
335 aa  349  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  55.93 
 
 
333 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  55.93 
 
 
333 aa  348  9e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  55.93 
 
 
333 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  55.93 
 
 
333 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  53.85 
 
 
335 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  55.32 
 
 
333 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  55.02 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  54.71 
 
 
333 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  55.66 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.4 
 
 
317 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.54 
 
 
322 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  35.91 
 
 
412 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  41.18 
 
 
405 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  41.18 
 
 
405 aa  210  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.53 
 
 
383 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.5 
 
 
304 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.45 
 
 
302 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.94 
 
 
303 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.94 
 
 
303 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.94 
 
 
303 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  33.84 
 
 
377 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.24 
 
 
335 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  33.54 
 
 
377 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.64 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  36.71 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  32.54 
 
 
375 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  32.54 
 
 
375 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
375 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
375 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.96 
 
 
299 aa  158  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  34.48 
 
 
372 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.45 
 
 
374 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  32.24 
 
 
375 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  34.14 
 
 
374 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.41 
 
 
302 aa  155  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.46 
 
 
302 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.23 
 
 
304 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.04 
 
 
310 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.59 
 
 
313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.49 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.29 
 
 
495 aa  126  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.8 
 
 
443 aa  126  6e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  30.64 
 
 
374 aa  126  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.17 
 
 
488 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.02 
 
 
512 aa  122  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  30.16 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.16 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.92 
 
 
490 aa  120  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.72 
 
 
563 aa  120  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 
412 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.82 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.18 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.3 
 
 
414 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.43 
 
 
516 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.74 
 
 
319 aa  116  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.14 
 
 
505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  28.01 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.11 
 
 
502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.02 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  30.25 
 
 
427 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  29.5 
 
 
380 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.19 
 
 
436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.17 
 
 
527 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.43 
 
 
353 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.04 
 
 
503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>