More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0015 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 503 aa  986    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  71.74 
 
 		 505 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1876  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.53 
 
 		 455 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000275813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4851  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.76 
 
 		 432 aa  209  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.1 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.94 
 
 		 353 aa  196  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3226  cell envelope-related transcriptional attenuator  45.49 
 
 		 370 aa  181  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.03 
 
 		 461 aa  176  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.03 
 
 		 412 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.26 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.2 
 
 		 585 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.15 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.85 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1714  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.19 
 
 		 528 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1700  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.91 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.89 
 
 		 383 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.87 
 
 		 419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.18 
 
 		 411 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  31.17 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  31.17 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  31.56 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  31.17 
 
 		 375 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  31.56 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.46 
 
 		 308 aa  128  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.02 
 
 		 319 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.11 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  30.67 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.19 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.02 
 
 		 303 aa  124  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  30.67 
 
 		 372 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.9 
 
 		 490 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.75 
 
 		 337 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.4 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  35 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  35 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  36.84 
 
 		 337 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.8 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  34.5 
 
 		 338 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  34 
 
 		 337 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  34 
 
 		 337 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  34 
 
 		 333 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  34 
 
 		 338 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.34 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.4 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.78 
 
 		 407 aa  114  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.865299 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.3 
 
 		 495 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.91 
 
 		 317 aa  114  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.38 
 
 		 426 aa  113  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.49 
 
 		 344 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  29.74 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.55 
 
 		 304 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.68 
 
 		 333 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  29.74 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.96 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  35.14 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  35.14 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  35.68 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  35.14 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  35.68 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  35.14 
 
 		 333 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  34.97 
 
 		 333 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.29 
 
 		 329 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  30.04 
 
 		 400 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.58 
 
 		 335 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  32.77 
 
 		 505 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.41 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.45 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.11 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.29 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  30.87 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  30.87 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.5 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  30.87 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.69 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  29.12 
 
 		 400 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.63 
 
 		 304 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.64 
 
 		 333 aa  108  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.35 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  31 
 
 		 349 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.47 
 
 		 328 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.03 
 
 		 443 aa  107  7e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  30.63 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.45 
 
 		 302 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.55 
 
 		 304 aa  103  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.45 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.65 
 
 		 563 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.54 
 
 		 506 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2170  cell envelope-related function transcriptional attenuator  33.01 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.08 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>