More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4851 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4851  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 432 aa  879    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.28 
 
 		 503 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.83 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1876  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.97 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000275813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.4 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.32 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3226  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.46 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.59 
 
 		 451 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.74 
 
 		 377 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.41 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.22 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1700  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.11 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.1 
 
 		 527 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1714  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.42 
 
 		 528 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.19 
 
 		 585 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.82 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.96 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.23 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  30.2 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  29.63 
 
 		 333 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  29.53 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  29.53 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  29.53 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  29.53 
 
 		 333 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 335 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.31 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.42 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  28.84 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  30.6 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  30.6 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  29.19 
 
 		 333 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  30.6 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  30.6 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.86 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  31.03 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  28.09 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 317 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  28.09 
 
 		 377 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.49 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  32.69 
 
 		 399 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  27.72 
 
 		 374 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.52 
 
 		 374 aa  99  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.48 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.69 
 
 		 329 aa  98.2  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  27.78 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  27.78 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  27.34 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1433  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.03 
 
 		 332 aa  97.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  32.69 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  32.69 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5021  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.11 
 
 		 312 aa  96.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.09 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.78 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  27.42 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1208  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.51 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000721845  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  29.78 
 
 		 358 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  31.4 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.5 
 
 		 401 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  31.4 
 
 		 398 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  31.4 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30 
 
 		 304 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.26 
 
 		 302 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.7 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  31.88 
 
 		 400 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.95 
 
 		 344 aa  92.8  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.3 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.17 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1739  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.31 
 
 		 302 aa  92.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.97 
 
 		 488 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  28.3 
 
 		 349 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.84 
 
 		 497 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.7 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.95 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.81 
 
 		 549 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 334 aa  90.5  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.83 
 
 		 333 aa  90.5  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.9 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.09 
 
 		 313 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.74 
 
 		 303 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0632  psr protein  33.17 
 
 		 457 aa  89.7  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.513825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.74 
 
 		 303 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.66 
 
 		 303 aa  89.7  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.74 
 
 		 303 aa  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.64 
 
 		 345 aa  89.7  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.67 
 
 		 304 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0921  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.51 
 
 		 515 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.455476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.62 
 
 		 509 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  30.49 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.3 
 
 		 379 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.91 
 
 		 294 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>