More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0523 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 
337 aa  686    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  84.57 
 
 
338 aa  586  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  85.46 
 
 
338 aa  567  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  84.27 
 
 
337 aa  564  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  85.46 
 
 
338 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  85.46 
 
 
337 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  85.76 
 
 
337 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  85.16 
 
 
338 aa  565  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  84.87 
 
 
338 aa  566  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  85.16 
 
 
337 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  85.59 
 
 
333 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  67.17 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  67.17 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  67.17 
 
 
335 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  67.17 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  67.17 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  66.27 
 
 
333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  66.47 
 
 
333 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  66.77 
 
 
333 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  65.36 
 
 
335 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  66.77 
 
 
333 aa  448  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  64.05 
 
 
329 aa  411  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  58.39 
 
 
317 aa  364  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  58.31 
 
 
399 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  56.27 
 
 
401 aa  361  8e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  57.99 
 
 
399 aa  360  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  57.37 
 
 
400 aa  358  5e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  55.66 
 
 
398 aa  354  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  54.81 
 
 
388 aa  353  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  55.05 
 
 
398 aa  352  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  55.05 
 
 
398 aa  352  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  55.05 
 
 
398 aa  352  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  55.05 
 
 
398 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  55.35 
 
 
400 aa  351  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  54.52 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  52.34 
 
 
345 aa  335  9e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  51.16 
 
 
345 aa  334  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  51.16 
 
 
345 aa  334  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  51.46 
 
 
345 aa  332  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  54.04 
 
 
345 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  54.04 
 
 
345 aa  332  8e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  51.46 
 
 
345 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  54.04 
 
 
345 aa  330  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  53.73 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.47 
 
 
322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  39.88 
 
 
412 aa  225  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  42.49 
 
 
405 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  42.49 
 
 
405 aa  222  6e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.18 
 
 
383 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.61 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.44 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.24 
 
 
310 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.4 
 
 
335 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.46 
 
 
313 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  39.93 
 
 
377 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.16 
 
 
374 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  39.93 
 
 
374 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  39.59 
 
 
372 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  40.4 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.05 
 
 
303 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.05 
 
 
303 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  39.25 
 
 
377 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.49 
 
 
299 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.05 
 
 
303 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  38.57 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  38.57 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.66 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.74 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  39.71 
 
 
375 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.97 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.04 
 
 
302 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.98 
 
 
318 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  30.98 
 
 
318 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  34.63 
 
 
374 aa  155  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  31.79 
 
 
316 aa  153  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.63 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.77 
 
 
488 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.29 
 
 
445 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.19 
 
 
308 aa  139  7e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.01 
 
 
563 aa  139  8.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.83 
 
 
495 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.87 
 
 
426 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.71 
 
 
405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.08 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.64 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.99 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  30.81 
 
 
427 aa  130  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 
453 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  28.8 
 
 
334 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  30.31 
 
 
374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.86 
 
 
436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.87 
 
 
490 aa  127  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.23 
 
 
512 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 
380 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.47 
 
 
406 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  35 
 
 
505 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.75 
 
 
503 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.83 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>