More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0174 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  100 
 
 		 374 aa  771    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  41.64 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  46.21 
 
 		 334 aa  249  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  41.78 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.55 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.85 
 
 		 488 aa  230  3e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.29 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  41.12 
 
 		 302 aa  230  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.67 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.67 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.67 
 
 		 303 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.67 
 
 		 303 aa  219  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.94 
 
 		 304 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.51 
 
 		 299 aa  209  9e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.58 
 
 		 304 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  38.84 
 
 		 427 aa  206  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  36.48 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.54 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.1 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  37.34 
 
 		 435 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.25 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 296 aa  184  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 410 aa  175  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.11 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  34.11 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  32.04 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.76 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.12 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  34.63 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  32.73 
 
 		 377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  32.73 
 
 		 377 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  33.58 
 
 		 375 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 375 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  33.97 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  33.85 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  33.85 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.5 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.38 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  30.49 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  31 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  31.21 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  31 
 
 		 337 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.72 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  32.25 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  31.85 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  32.25 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  32.25 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  31.85 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  31.85 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  31.21 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  31.53 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.37 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  31.6 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  30.28 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  31.6 
 
 		 333 aa  136  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 308 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.03 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  31.09 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  31.41 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  28.48 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 475 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  28.38 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  28.38 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.26 
 
 		 481 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.26 
 
 		 481 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  34.08 
 
 		 471 aa  119  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  29.11 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  29.11 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.94 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  29.39 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.02 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.94 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.59 
 
 		 563 aa  114  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.74 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.46 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.25 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.97 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.52 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.46 
 
 		 414 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  38.38 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  30.12 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  28.53 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  28.53 
 
 		 345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  28.53 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  28.48 
 
 		 345 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  29.82 
 
 		 345 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.44 
 
 		 362 aa  109  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 		 585 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.1 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.78 
 
 		 516 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  30.86 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3081  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.9 
 
 		 531 aa  106  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>