More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1715 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  100 
 
 		 374 aa  780    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  43.94 
 
 		 374 aa  278  8e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.64 
 
 		 488 aa  243  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.91 
 
 		 313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  39.22 
 
 		 310 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.93 
 
 		 302 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  42.55 
 
 		 304 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  42.86 
 
 		 299 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.46 
 
 		 333 aa  203  5e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  46.88 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  44.98 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.08 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.08 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  38.08 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  37.72 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  43.91 
 
 		 304 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  45.41 
 
 		 302 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  34.94 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  33.95 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  36.95 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  34.77 
 
 		 386 aa  172  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  35.58 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  35.58 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  35.58 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  35.26 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  35.26 
 
 		 333 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  35.26 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.33 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  35.26 
 
 		 333 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 410 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.58 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  30.87 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  35.03 
 
 		 320 aa  163  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  30.55 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  31.05 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  31.05 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  31.05 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  33.56 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.08 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.86 
 
 		 374 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  33.21 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  32.72 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  35.43 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  35.43 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  35.43 
 
 		 338 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.41 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  34.31 
 
 		 338 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  34.31 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.63 
 
 		 337 aa  155  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  33.99 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  33.99 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  32.26 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  32.97 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.99 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.6 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  33.6 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  30.56 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.69 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  31.14 
 
 		 345 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  31.72 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  31.72 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  30.63 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  31.14 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  31.52 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  31.52 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.94 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  30.03 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  30.03 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  29.73 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  30.03 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.63 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  32.42 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  30.9 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.6 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  30.52 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.45 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  31.8 
 
 		 399 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  30.9 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  30.9 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.85 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  30.9 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.45 
 
 		 490 aa  119  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.03 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.22 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.7 
 
 		 563 aa  115  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.82 
 
 		 512 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.74 
 
 		 495 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.05 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  29.84 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 		 481 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>