More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0368 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  889    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  54.93 
 
 		 408 aa  438  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  41.28 
 
 		 450 aa  249  7e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  35.42 
 
 		 304 aa  189  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.37 
 
 		 310 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  35.69 
 
 		 302 aa  186  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  35.74 
 
 		 304 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.26 
 
 		 488 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.23 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.76 
 
 		 303 aa  176  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.22 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.22 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  37.9 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.89 
 
 		 303 aa  173  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33 
 
 		 299 aa  170  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  35.81 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  35.81 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  35.71 
 
 		 375 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  35.37 
 
 		 377 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  35.34 
 
 		 302 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  35.69 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.67 
 
 		 304 aa  168  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  36.01 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.61 
 
 		 383 aa  166  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  34.65 
 
 		 372 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.64 
 
 		 333 aa  163  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.18 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.74 
 
 		 374 aa  156  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 386 aa  152  8e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 410 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 296 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  31.07 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.05 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 318 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  31.25 
 
 		 318 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.46 
 
 		 322 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  28.87 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.69 
 
 		 512 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.58 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.32 
 
 		 516 aa  117  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  29.78 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  29.78 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  29.78 
 
 		 333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.02 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.96 
 
 		 497 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 		 333 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  30.33 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.88 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  30.33 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  31.78 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.91 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.52 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  30 
 
 		 335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  31.98 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  31.98 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.5 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.51 
 
 		 563 aa  110  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.75 
 
 		 443 aa  109  8.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  32 
 
 		 313 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  29.71 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.22 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  31.25 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  30 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  30 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  29.57 
 
 		 345 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.39 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  30.47 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  36.69 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  29.69 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  29.69 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.87 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  29.44 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  29.18 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  29.44 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  29.18 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  29.44 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  29.18 
 
 		 345 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  28.27 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3081  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.54 
 
 		 531 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.74 
 
 		 356 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  30.05 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  28.27 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.15 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.01 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.21 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.55 
 
 		 490 aa  101  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.48 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  26.51 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>