More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2604 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 471 aa  969    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  60.89 
 
 		 475 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  57.5 
 
 		 481 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  57.27 
 
 		 481 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  54 
 
 		 472 aa  487  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  49.13 
 
 		 471 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.77 
 
 		 492 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.55 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.58 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.38 
 
 		 502 aa  282  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.28 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.76 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2679  cell envelope-like transcriptional attenuator  37.4 
 
 		 503 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1762  cell envelope-like transcriptional attenuator  36.86 
 
 		 501 aa  259  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.103676  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  42.26 
 
 		 337 aa  213  7.999999999999999e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.26 
 
 		 377 aa  201  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2282  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.76 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.072814  hitchhiker  0.000000103578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.16 
 
 		 384 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.65 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.61 
 
 		 445 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.56 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.55 
 
 		 308 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.68 
 
 		 419 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.83 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.8 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.79 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.43 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.5 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.07 
 
 		 344 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.17 
 
 		 308 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 380 aa  140  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.26 
 
 		 426 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.32 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.25 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.03 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  30.63 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  30.32 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  30.32 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  30.32 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 375 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 375 aa  127  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.63 
 
 		 344 aa  127  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  30.32 
 
 		 377 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  29.93 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.15 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.78 
 
 		 303 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  29.96 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0666  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.51 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  31.34 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  34.84 
 
 		 334 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.37 
 
 		 374 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.63 
 
 		 302 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  31.72 
 
 		 437 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09711  membrane bound transcriptional regulator-like protein  33.48 
 
 		 298 aa  120  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.63 
 
 		 303 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.63 
 
 		 303 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.15 
 
 		 304 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.26 
 
 		 303 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.57 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.26 
 
 		 303 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.61 
 
 		 563 aa  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.62 
 
 		 490 aa  117  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.52 
 
 		 302 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.41 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.59 
 
 		 333 aa  113  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  35.67 
 
 		 327 aa  113  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.67 
 
 		 327 aa  113  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.96 
 
 		 377 aa  113  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.85 
 
 		 322 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  33.17 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.22 
 
 		 313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.16 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.17 
 
 		 329 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.65 
 
 		 338 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  28.88 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  29.52 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  28.88 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  28.88 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  30.5 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 335 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  26.69 
 
 		 338 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  29.39 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  29.39 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  28.79 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  29.39 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  29.07 
 
 		 333 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.29 
 
 		 302 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  28.7 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  28.63 
 
 		 335 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.58 
 
 		 328 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.5 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  26.57 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0189  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.62 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.63 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  28.7 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>