More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2953 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 
502 aa  1026    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  65.14 
 
 
492 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  65.14 
 
 
492 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  51.74 
 
 
451 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.63 
 
 
456 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1762  cell envelope-like transcriptional attenuator  45.22 
 
 
501 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.103676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2679  cell envelope-like transcriptional attenuator  44.52 
 
 
503 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  51.32 
 
 
436 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.67 
 
 
475 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  42.48 
 
 
472 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  43.04 
 
 
471 aa  310  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.13 
 
 
481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.91 
 
 
481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.38 
 
 
471 aa  283  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  45.27 
 
 
337 aa  213  9e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.42 
 
 
384 aa  194  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2282  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.95 
 
 
389 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.072814  hitchhiker  0.000000103578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 
411 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.43 
 
 
414 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.46 
 
 
445 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.78 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.65 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.28 
 
 
377 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.62 
 
 
405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.84 
 
 
319 aa  155  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.77 
 
 
344 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.86 
 
 
418 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.31 
 
 
403 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.21 
 
 
406 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.98 
 
 
308 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 
380 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.12 
 
 
344 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.97 
 
 
426 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  32.94 
 
 
437 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.08 
 
 
308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  32.3 
 
 
437 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  36.54 
 
 
412 aa  128  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.14 
 
 
495 aa  127  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  37.02 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  37.02 
 
 
405 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.62 
 
 
439 aa  127  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.2 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.59 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  36.89 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  36.89 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  36.89 
 
 
333 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  35.59 
 
 
333 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
333 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
335 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.94 
 
 
490 aa  121  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  35.59 
 
 
333 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  35.59 
 
 
333 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  36.41 
 
 
333 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.74 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.87 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.06 
 
 
310 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.43 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.25 
 
 
313 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
383 aa  117  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.48 
 
 
417 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.91 
 
 
318 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  31.91 
 
 
318 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  35.55 
 
 
374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  32.11 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  35.55 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  34.6 
 
 
375 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.43 
 
 
374 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  35.41 
 
 
377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  34.6 
 
 
375 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  34.6 
 
 
375 aa  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.42 
 
 
443 aa  114  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.78 
 
 
584 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
375 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
375 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  32.33 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.34 
 
 
345 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.06 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.41 
 
 
271 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1641  cell envelope-related function transcriptional attenuator  31.44 
 
 
314 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  34.93 
 
 
377 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.46 
 
 
299 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.34 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.37 
 
 
338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  28.93 
 
 
316 aa  111  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  33.78 
 
 
337 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
337 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
398 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.56 
 
 
303 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  33.78 
 
 
333 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  33.78 
 
 
338 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  31.49 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.8 
 
 
304 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.34 
 
 
322 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  31.49 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  31.82 
 
 
327 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.82 
 
 
327 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  31.9 
 
 
400 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.47 
 
 
401 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1244  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.17 
 
 
445 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000703915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  34.3 
 
 
338 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>