More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2679 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2679  cell envelope-like transcriptional attenuator  100 
 
 		 503 aa  1011    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1762  cell envelope-like transcriptional attenuator  73.81 
 
 		 501 aa  752    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.103676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.52 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.86 
 
 		 456 aa  362  6e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.52 
 
 		 492 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.52 
 
 		 492 aa  356  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.36 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.66 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.73 
 
 		 475 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.9 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.9 
 
 		 481 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.4 
 
 		 471 aa  267  4e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  38.07 
 
 		 471 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  38.34 
 
 		 472 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.52 
 
 		 384 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  38.02 
 
 		 337 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2282  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.79 
 
 		 389 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.072814  hitchhiker  0.000000103578 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.3 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.16 
 
 		 377 aa  147  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.31 
 
 		 419 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.75 
 
 		 445 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 380 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.83 
 
 		 405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.87 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.87 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.61 
 
 		 414 aa  137  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.7 
 
 		 308 aa  133  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.3 
 
 		 344 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.77 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.62 
 
 		 319 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.21 
 
 		 374 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  33.2 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  33.2 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 372 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  32.79 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  32.79 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  32.79 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.46 
 
 		 426 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  30.22 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.84 
 
 		 383 aa  117  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.51 
 
 		 509 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.17 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.81 
 
 		 308 aa  114  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.88 
 
 		 516 aa  113  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.6 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.83 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  30.77 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  30.77 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.98 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  30.12 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  29.73 
 
 		 399 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.2 
 
 		 497 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  29.34 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.39 
 
 		 618 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0875  LytR family transcription antiterminator  29.73 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0676567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  28.96 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.12 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  28.96 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  32.71 
 
 		 333 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  32.71 
 
 		 333 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 333 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 335 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.28 
 
 		 495 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  32.71 
 
 		 333 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  28.57 
 
 		 398 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.89 
 
 		 584 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0666  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.92 
 
 		 377 aa  106  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  33.77 
 
 		 333 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 335 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 333 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.75 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.31 
 
 		 333 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.62 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  28.62 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.89 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.99 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.51 
 
 		 322 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1244  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.34 
 
 		 445 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000703915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  22.7 
 
 		 437 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.18 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.08 
 
 		 506 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.81 
 
 		 335 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.88 
 
 		 304 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.3 
 
 		 468 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  22.43 
 
 		 437 aa  100  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.37 
 
 		 304 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.79 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  28.51 
 
 		 345 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.41 
 
 		 313 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.94 
 
 		 311 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.04 
 
 		 303 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.04 
 
 		 303 aa  98.6  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>