More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1232 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 377 aa  755    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2282  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.89 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.072814  hitchhiker  0.000000103578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.93 
 
 		 384 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.43 
 
 		 475 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.54 
 
 		 451 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.75 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  35.34 
 
 		 472 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  35.84 
 
 		 471 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.26 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.26 
 
 		 481 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.23 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.47 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.17 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.98 
 
 		 456 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.28 
 
 		 502 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.81 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  38.85 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.4 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.87 
 
 		 453 aa  153  5e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.46 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.48 
 
 		 414 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.28 
 
 		 419 aa  149  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  42 
 
 		 411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1762  cell envelope-like transcriptional attenuator  36.71 
 
 		 501 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.103676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.57 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2679  cell envelope-like transcriptional attenuator  30.16 
 
 		 503 aa  139  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.12 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.67 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1641  cell envelope-related function transcriptional attenuator  39.23 
 
 		 314 aa  133  5e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.63 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.51 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.94 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09711  membrane bound transcriptional regulator-like protein  38.69 
 
 		 298 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.76 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.76 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.91 
 
 		 271 aa  126  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.95 
 
 		 437 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.03 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.86 
 
 		 584 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0754  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.5 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0493984  hitchhiker  0.0069249 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  28.49 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.04 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.1 
 
 		 390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.37 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  35.78 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  39.66 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  30.93 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  30.93 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.12 
 
 		 322 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  30.93 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.51 
 
 		 344 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.34 
 
 		 453 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  31.36 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  31.36 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  31.36 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 573 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  30.51 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.36 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  31 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.24 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  31 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0666  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.83 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.24 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  40 
 
 		 404 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  31 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  31 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  31 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.45 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  31 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1774  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.7 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0243051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  31 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  31.22 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.18 
 
 		 307 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.2 
 
 		 466 aa  99.8  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  34.04 
 
 		 412 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 486 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.23 
 
 		 516 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.88 
 
 		 563 aa  98.2  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.57 
 
 		 333 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  30.57 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  31.63 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  31.63 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  30.36 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 335 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.84 
 
 		 509 aa  97.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  31.63 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.62 
 
 		 545 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.36 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.57 
 
 		 338 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  39.6 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.67 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  30.36 
 
 		 335 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.93 
 
 		 320 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.05 
 
 		 497 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>