More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0961 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  100 
 
 
337 aa  674    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.94 
 
 
451 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  41.79 
 
 
472 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.09 
 
 
492 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.19 
 
 
475 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.7 
 
 
492 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  41.05 
 
 
471 aa  216  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.19 
 
 
481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  45.27 
 
 
502 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.43 
 
 
481 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.26 
 
 
471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.75 
 
 
436 aa  208  9e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.71 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2282  cell envelope-related transcriptional attenuator  45.02 
 
 
389 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.072814  hitchhiker  0.000000103578 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.76 
 
 
419 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.86 
 
 
384 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.85 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1762  cell envelope-like transcriptional attenuator  38.43 
 
 
501 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.103676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.34 
 
 
411 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2679  cell envelope-like transcriptional attenuator  38.02 
 
 
503 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.71 
 
 
308 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.5 
 
 
453 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.33 
 
 
319 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.77 
 
 
405 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  35.27 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.52 
 
 
403 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.81 
 
 
418 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.97 
 
 
414 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  32.8 
 
 
377 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.8 
 
 
344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  32.4 
 
 
375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  32.4 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  32.4 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  32.4 
 
 
375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  30.11 
 
 
374 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.63 
 
 
374 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  30.11 
 
 
372 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 
383 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.61 
 
 
271 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.41 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.2 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.2 
 
 
439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.88 
 
 
417 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.6 
 
 
406 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.09 
 
 
426 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.71 
 
 
344 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.19 
 
 
303 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  29.1 
 
 
318 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.69 
 
 
490 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.1 
 
 
318 aa  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1641  cell envelope-related function transcriptional attenuator  33.68 
 
 
314 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.85 
 
 
390 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  26.91 
 
 
412 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0666  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.87 
 
 
377 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  29.27 
 
 
316 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.64 
 
 
495 aa  102  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  36.11 
 
 
505 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  36 
 
 
497 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0931  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.77 
 
 
397 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00105119  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0953  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.77 
 
 
370 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0121722  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09711  membrane bound transcriptional regulator-like protein  30.94 
 
 
298 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  28.7 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.34 
 
 
294 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.86 
 
 
377 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  25.44 
 
 
405 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  25.44 
 
 
405 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.37 
 
 
584 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1451  transcription attenuator LytR  28.44 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.35 
 
 
437 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.57 
 
 
340 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1423  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.44 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302612  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.63 
 
 
512 aa  97.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.87 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1244  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.47 
 
 
445 aa  97.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000703915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  28.35 
 
 
437 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  28.77 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.51 
 
 
443 aa  97.4  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5265  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.46 
 
 
414 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.33 
 
 
504 aa  96.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.75 
 
 
303 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.65 
 
 
313 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
404 aa  95.5  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.34 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  30.81 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.95 
 
 
304 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0189  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.28 
 
 
403 aa  94  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.93 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.93 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.52 
 
 
563 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.8 
 
 
442 aa  93.2  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1005  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.1 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3081  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
531 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.42 
 
 
335 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.68 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.84 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.3 
 
 
304 aa  92.8  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>