More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0189 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0189  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 403 aa  823    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1005  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.46 
 
 		 285 aa  168  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.65 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  34.19 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  34.19 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  34.19 
 
 		 375 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  33.76 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.57 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  33.33 
 
 		 377 aa  146  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.06 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 377 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.55 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.05 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.07 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.05 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.05 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.09 
 
 		 405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.21 
 
 		 453 aa  133  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.04 
 
 		 329 aa  131  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  34.19 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  34.19 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  34.19 
 
 		 338 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  33.87 
 
 		 337 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  34.62 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  31.7 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.91 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  30.95 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  30.95 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  30.95 
 
 		 333 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  34.35 
 
 		 338 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 335 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  34.35 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  31.37 
 
 		 333 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  31.98 
 
 		 333 aa  126  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.05 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2233  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.32 
 
 		 303 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  31.58 
 
 		 335 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.65 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.19 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.87 
 
 		 310 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.06 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.86 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.48 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.62 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.54 
 
 		 411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.6 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.92 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.68 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.04 
 
 		 317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.17 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.05 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  31.3 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.3 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.08 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.08 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.07 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.95 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  30 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.62 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.96 
 
 		 549 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.92 
 
 		 509 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.22 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  32.79 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.22 
 
 		 304 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.83 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.38 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.2 
 
 		 303 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.2 
 
 		 303 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.79 
 
 		 271 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.2 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  33.2 
 
 		 437 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  33.48 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.21 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.38 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.2 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.4 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  26.62 
 
 		 337 aa  107  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  27.7 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.69 
 
 		 527 aa  106  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.3 
 
 		 504 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  32.48 
 
 		 471 aa  106  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.61 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.72 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.17 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  25.76 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  33.7 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.53 
 
 		 497 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.84 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.865299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.13 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  31.03 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0666  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.14 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.55 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.23 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>