More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2090 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2090  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 417 aa  843    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.08 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.81 
 
 		 405 aa  156  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.09 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.94 
 
 		 453 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3856  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.49 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1232  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.67 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.113674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.65 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.39 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 		 308 aa  133  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.58 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1762  cell envelope-like transcriptional attenuator  29.7 
 
 		 501 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.103676  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.07 
 
 		 319 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.44 
 
 		 384 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.2 
 
 		 322 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.76 
 
 		 492 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  33.46 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2524  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.49 
 
 		 492 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1138  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.86 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1109  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.86 
 
 		 481 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2282  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.04 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.072814  hitchhiker  0.000000103578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 		 344 aa  122  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1857  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.55 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.046941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  35.27 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  28.53 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.94 
 
 		 563 aa  120  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.17 
 
 		 344 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.26 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.96 
 
 		 502 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.01 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0411  cell envelope-like transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  28.95 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  28.95 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  28.95 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  28.95 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.04 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  28.62 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.07 
 
 		 509 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0961  cell envelope-related function transcriptional attenuator  32.88 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.472241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  28.29 
 
 		 335 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.24 
 
 		 333 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  28.62 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.34 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0152  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.9 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0727  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.76 
 
 		 308 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0775994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3102  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.84 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.16 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0754  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.33 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0493984  hitchhiker  0.0069249 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0666  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.53 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.76 
 
 		 302 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.86 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.51 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2679  cell envelope-like transcriptional attenuator  26.98 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.77 
 
 		 329 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.2 
 
 		 338 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.18 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.53 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  28.16 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  28.16 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.04 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.14 
 
 		 299 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1641  cell envelope-related function transcriptional attenuator  30.38 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.3 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  28.16 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.43 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.4 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.35 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  28.16 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  30.35 
 
 		 338 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  30.35 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  30.35 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  24.94 
 
 		 512 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.57 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.78 
 
 		 313 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.53 
 
 		 302 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.29 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  29.29 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.14 
 
 		 303 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.79 
 
 		 337 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.79 
 
 		 304 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  29.69 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  25 
 
 		 490 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.8 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  29.57 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.8 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  29.57 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  27.44 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.63 
 
 		 584 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  29.51 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  26.8 
 
 		 303 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 328 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>