More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0489 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  100 
 
 
450 aa  908    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  41.28 
 
 
435 aa  250  4e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  39.23 
 
 
408 aa  234  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.09 
 
 
302 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1715  transcriptional regulator  30.56 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565214 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.49 
 
 
488 aa  134  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0961  transcriptional regulator  32.46 
 
 
410 aa  133  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  34.11 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.56 
 
 
333 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  30.72 
 
 
374 aa  130  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.97 
 
 
304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.23 
 
 
302 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  30.23 
 
 
392 aa  127  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.9 
 
 
299 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.19 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3796  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.56 
 
 
302 aa  127  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000323774  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0332  transcriptional regulator  30.69 
 
 
386 aa  126  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.08 
 
 
304 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.49 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.49 
 
 
303 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.32 
 
 
313 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.49 
 
 
303 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.92 
 
 
383 aa  123  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.28 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  29.47 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1438  transcriptional regulator  32 
 
 
320 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000544973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  28.97 
 
 
377 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.61 
 
 
563 aa  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  28.97 
 
 
377 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  28.97 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  28.97 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  28.97 
 
 
375 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0435  transcriptional regulator  30.33 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1157  transcriptional regulator  31.32 
 
 
334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000266671  hitchhiker  6.72858e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  28.48 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  28.48 
 
 
372 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.42 
 
 
318 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  31.42 
 
 
318 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.3 
 
 
374 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.02 
 
 
585 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  30 
 
 
316 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
495 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.63 
 
 
319 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.63 
 
 
512 aa  98.6  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.18 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.79 
 
 
443 aa  97.8  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  26.07 
 
 
516 aa  97.4  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.09 
 
 
335 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.85 
 
 
490 aa  95.1  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3081  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.84 
 
 
531 aa  94  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1714  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.57 
 
 
528 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.603952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  25.99 
 
 
337 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.48 
 
 
362 aa  93.2  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.4 
 
 
338 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  26.13 
 
 
338 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  26.13 
 
 
338 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.41 
 
 
403 aa  91.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.7 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  25.66 
 
 
338 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.26 
 
 
527 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.62 
 
 
406 aa  90.1  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.45 
 
 
407 aa  90.1  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.865299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  30.84 
 
 
481 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.89 
 
 
356 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0694  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.42 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.12922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.69 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1138  transcription attenuator LytR  26.21 
 
 
405 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.195072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.02 
 
 
317 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.06 
 
 
506 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1115  hypothetical protein  26.21 
 
 
405 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.108667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  25.66 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3273  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.69 
 
 
345 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  27.76 
 
 
437 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0648  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.79 
 
 
388 aa  87  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.500203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  25.64 
 
 
345 aa  87  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2679  cell envelope-like transcriptional attenuator  28.64 
 
 
503 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.29 
 
 
328 aa  86.7  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3381  LytR family transcription antiterminator  25.27 
 
 
345 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.288134  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.81 
 
 
521 aa  86.3  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  25.27 
 
 
345 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3647  LytR family transcription antiterminator  25.27 
 
 
345 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3598  transcription antiterminator, LytR family  25.27 
 
 
345 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000156827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  25.66 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  25.66 
 
 
400 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0640  transcriptional regulator, putative  26.92 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00230389  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3223  cell envelope-like transcriptional attenuator  28.35 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  27.34 
 
 
437 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.92 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.2 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.34 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  26.14 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  26.14 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  26.14 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1275  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.23 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000150477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 
340 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.69 
 
 
549 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>