More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1876 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1876  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 
455 aa  904    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000275813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.41 
 
 
503 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.2 
 
 
505 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4851  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.91 
 
 
432 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.3 
 
 
356 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.26 
 
 
353 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3226  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.33 
 
 
370 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.4 
 
 
527 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.54 
 
 
377 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.16 
 
 
412 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.74 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1714  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.57 
 
 
528 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.603952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.23 
 
 
451 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  36 
 
 
585 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1700  cell envelope-related transcriptional attenuator  36 
 
 
463 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.96 
 
 
563 aa  137  4e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.48 
 
 
490 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.88 
 
 
418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.9 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.37 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.65 
 
 
411 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.68 
 
 
516 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.22 
 
 
495 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.4 
 
 
390 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.07 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.44 
 
 
338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  34.96 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.06 
 
 
319 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.37 
 
 
377 aa  114  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  31 
 
 
338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  31 
 
 
338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  31.44 
 
 
337 aa  114  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  30.04 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  30.04 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.91 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  30.04 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.67 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  31 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  31.39 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  31.39 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.98 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.89 
 
 
329 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  29.64 
 
 
377 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  31.39 
 
 
337 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.66 
 
 
478 aa  111  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.86 
 
 
344 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.86 
 
 
333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.14 
 
 
302 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.17 
 
 
406 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.91 
 
 
299 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.08 
 
 
317 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.27 
 
 
487 aa  110  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.3 
 
 
497 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
337 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.8 
 
 
426 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.83 
 
 
383 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  29.6 
 
 
374 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.68 
 
 
381 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5265  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.43 
 
 
414 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.9 
 
 
307 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  31.22 
 
 
333 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  31.22 
 
 
333 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  31.02 
 
 
335 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
333 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
335 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  31.22 
 
 
333 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.92 
 
 
436 aa  108  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  31.22 
 
 
333 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.87 
 
 
504 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.13 
 
 
374 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  31.67 
 
 
333 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.36 
 
 
521 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2953  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.77 
 
 
502 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  29.2 
 
 
372 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  30.77 
 
 
333 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.26 
 
 
407 aa  107  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.865299 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  28.85 
 
 
377 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.3 
 
 
389 aa  106  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.61 
 
 
322 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.02 
 
 
308 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.63 
 
 
304 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1881  cell envelope-related function transcriptional attenuator  29.96 
 
 
460 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.723477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5058  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.06 
 
 
304 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2170  cell envelope-related function transcriptional attenuator  29.59 
 
 
473 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.582429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 
405 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5436  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.76 
 
 
302 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.64 
 
 
480 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  31.69 
 
 
326 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 
468 aa  103  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.19 
 
 
453 aa  103  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.77 
 
 
303 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  34.38 
 
 
481 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.77 
 
 
303 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.77 
 
 
618 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.36 
 
 
333 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3582  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.64 
 
 
492 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.77 
 
 
303 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>