More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1295 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 407 aa  843    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.865299 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.8 
 
 		 563 aa  214  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  38.48 
 
 		 516 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.28 
 
 		 495 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.78 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.69 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3081  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.56 
 
 		 531 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.59 
 
 		 490 aa  164  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.52 
 
 		 319 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.13 
 
 		 419 aa  142  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2449  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.99 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00377769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.45 
 
 		 426 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1921  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.03 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.87 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.28 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.96 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.89 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  31.54 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  33.47 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  33.47 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  31.95 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  32.78 
 
 		 377 aa  126  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 374 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  28.82 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  28.47 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.82 
 
 		 308 aa  119  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.65 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.03 
 
 		 512 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.44 
 
 		 505 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3430  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.77 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0225853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.74 
 
 		 486 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1875  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.83 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.78 
 
 		 503 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0378  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0016641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2377  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.02 
 
 		 344 aa  113  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00145979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1252  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.41 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912522  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.8 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.08 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.32 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.09 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  27.81 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.48 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.97 
 
 		 573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.16 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  29.69 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 489 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.08 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.21 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2873  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.16 
 
 		 475 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2090  transcription regulator LytR-like protein  28.66 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.853394  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.64 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1876  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.26 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000275813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.89 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  32 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.39 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.97 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  28.92 
 
 		 349 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.82 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0280  putative transcriptional regulator  34.13 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  31.02 
 
 		 505 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.08 
 
 		 317 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0612  putative transcriptional regulator  28.62 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0271  cell envelope-related function transcriptional attenuator  34.8 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.968761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.42 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.4 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5383  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.31 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.07 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.4 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.2 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2604  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.71 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.6 
 
 		 619 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.42 
 
 		 409 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0368  hypothetical protein  24.81 
 
 		 435 aa  103  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1732  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 296 aa  103  8e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5115  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.57 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5506  membrane-bound transcriptional regulator LytR  29.57 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00691653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.5 
 
 		 545 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.46 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  30.7 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4961  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.6 
 
 		 303 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0205697  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.52 
 
 		 584 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  30.7 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  30.7 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.91 
 
 		 337 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5355  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.17 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.86 
 
 		 585 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  28.48 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 		 338 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.95 
 
 		 453 aa  100  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  31.9 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1572  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.6 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0072424  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  27.3 
 
 		 313 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  30 
 
 		 337 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>