More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1822 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1822  heme exporter protein CcmA  100 
 
 		 194 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1421  heme exporter protein CcmA  56.77 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1119  heme exporter protein CcmA  55.31 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.927557  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  41.79 
 
 		 229 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  38.54 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2860  heme exporter protein CcmA  40.1 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.584644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.36 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.13 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.48 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.04 
 
 		 202 aa  121  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.17 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.17 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.79 
 
 		 210 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.17 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.17 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0213  heme exporter protein CcmA  44.67 
 
 		 230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256595  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.27 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.61 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.83 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.27 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1855  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.11 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125429  normal  0.876599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.27 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.83 
 
 		 218 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.85 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.08 
 
 		 215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  39.68 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.04 
 
 		 216 aa  117  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.82 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.84 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.29 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.46 
 
 		 219 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1801  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.92 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2647  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.67 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.122197  normal  0.0114626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.5 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.5 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  37.88 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  37.95 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  36.96 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0447  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.38 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.5 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.15 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.46 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3569  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.68 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.191066  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  36.92 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3853  heme exporter protein CcmA  37.76 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.09 
 
 		 218 aa  111  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.09 
 
 		 215 aa  111  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0459  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.38 
 
 		 212 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.573877  normal  0.123941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.25 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.02 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.5 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1413  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.84 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.31 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.6 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  38.78 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  33.16 
 
 		 236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  36.41 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.83 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.14 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3084  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.53 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.1 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  31.12 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.16 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.98 
 
 		 207 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1284  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.78 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.339928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0040  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.58 
 
 		 233 aa  104  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  31.8 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.63 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  33.16 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  30.65 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.3 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0918  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.11 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  36.65 
 
 		 331 aa  101  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.91 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  37.22 
 
 		 202 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0887  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.56 
 
 		 200 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.43 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.82 
 
 		 204 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  33.51 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  38.22 
 
 		 215 aa  98.6  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3663  heme exporter protein CcmA  37.19 
 
 		 212 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  hitchhiker  0.00457456 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.27 
 
 		 209 aa  97.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.39 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  35.75 
 
 		 246 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0322  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.97 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1180  heme exporter protein CcmA  36.07 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0999  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.47 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.1 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  36.11 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.3 
 
 		 204 aa  94.4  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.94 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0411  cytochrome c biogenesis protein CcmA  26.88 
 
 		 207 aa  93.2  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  32.81 
 
 		 314 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.94 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0409  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.17 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1544  heme exporter protein CcmA  38.83 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.42 
 
 		 208 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  25.89 
 
 		 247 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  27.86 
 
 		 232 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>