More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2860 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2860  heme exporter protein CcmA  100 
 
 
214 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.584644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3084  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41 
 
 
207 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1413  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.21 
 
 
210 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  38.19 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0459  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.54 
 
 
212 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.573877  normal  0.123941 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.52 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1855  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.2 
 
 
205 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125429  normal  0.876599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.59 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.71 
 
 
218 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.71 
 
 
215 aa  129  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0447  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.69 
 
 
210 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2647  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.54 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.122197  normal  0.0114626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  43.43 
 
 
229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1801  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.69 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.84 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  35.38 
 
 
213 aa  128  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.37 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.37 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.82 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.84 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1822  heme exporter protein CcmA  40.1 
 
 
194 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.92 
 
 
211 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.83 
 
 
215 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4989  heme exporter protein CcmA  39.38 
 
 
204 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  37.56 
 
 
216 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.35 
 
 
202 aa  121  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1180  heme exporter protein CcmA  40 
 
 
205 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  35.47 
 
 
212 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1284  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.51 
 
 
208 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.339928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.79 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  37.06 
 
 
215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.51 
 
 
226 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  40.21 
 
 
212 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.79 
 
 
233 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.5 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.98 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  36.22 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3663  heme exporter protein CcmA  39 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  hitchhiker  0.00457456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.79 
 
 
234 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.58 
 
 
217 aa  116  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.31 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.5 
 
 
218 aa  115  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.5 
 
 
218 aa  114  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.5 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.56 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.36 
 
 
200 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.75 
 
 
200 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.24 
 
 
219 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.27 
 
 
206 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.92 
 
 
215 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  33.33 
 
 
205 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  31.71 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  36.46 
 
 
212 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  34.92 
 
 
204 aa  111  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0999  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.71 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15365  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.99 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.65 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0213  heme exporter protein CcmA  40.91 
 
 
230 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.14 
 
 
216 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3853  heme exporter protein CcmA  35.9 
 
 
207 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113867  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0918  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.51 
 
 
200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0887  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.51 
 
 
200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2847  heme exporter protein CcmA  35.64 
 
 
210 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0803665  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  34.67 
 
 
215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.65 
 
 
204 aa  108  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  35.32 
 
 
225 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.2 
 
 
208 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.72 
 
 
210 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1119  heme exporter protein CcmA  37.37 
 
 
191 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.927557  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1683  heme exporter protein CcmA  36.65 
 
 
236 aa  106  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.83 
 
 
216 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.83 
 
 
216 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.83 
 
 
216 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.83 
 
 
216 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.04 
 
 
216 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1421  heme exporter protein CcmA  40.11 
 
 
194 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.33 
 
 
216 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.51 
 
 
216 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  34.5 
 
 
207 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  33.68 
 
 
236 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.59 
 
 
209 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.98 
 
 
217 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.97 
 
 
216 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  33.96 
 
 
220 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.97 
 
 
216 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  37.5 
 
 
188 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0322  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.68 
 
 
200 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.76 
 
 
205 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.43 
 
 
216 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.43 
 
 
216 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.45 
 
 
216 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1544  heme exporter protein CcmA  37.38 
 
 
234 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.03 
 
 
226 aa  99.8  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.5 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1560  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.47 
 
 
215 aa  99  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0600798  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  34.03 
 
 
266 aa  99.4  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  36.27 
 
 
207 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  36.27 
 
 
205 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.27 
 
 
205 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.27 
 
 
205 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>