More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0226 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  100 
 
 		 216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  99.54 
 
 		 216 aa  443  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  98.15 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  95.37 
 
 		 216 aa  430  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  94.44 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  93.98 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  94.44 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  94.44 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  94.44 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  84.83 
 
 		 217 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  83.33 
 
 		 216 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  84.26 
 
 		 216 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  83.8 
 
 		 216 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  81.02 
 
 		 216 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  80.09 
 
 		 216 aa  362  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3569  cytochrome c biogenesis protein CcmA  76.26 
 
 		 227 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.191066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  65.53 
 
 		 219 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  54.19 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  55.12 
 
 		 218 aa  214  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.37 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  55.61 
 
 		 218 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.66 
 
 		 204 aa  212  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  55.12 
 
 		 218 aa  211  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  54.9 
 
 		 207 aa  211  9e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.08 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.14 
 
 		 205 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  52.45 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50.26 
 
 		 206 aa  188  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  51.22 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  51.22 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.22 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.22 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  51.22 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.22 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.22 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.22 
 
 		 205 aa  184  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  49.21 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50.73 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  45.28 
 
 		 236 aa  177  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.11 
 
 		 211 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.42 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  47.45 
 
 		 223 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.42 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.42 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.44 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.44 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  49.21 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.92 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.92 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.68 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.68 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.68 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.68 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.68 
 
 		 207 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.23 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.07 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.5 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.92 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.5 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.16 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.35 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  43.94 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.41 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  43.17 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  41.29 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  43.46 
 
 		 204 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.78 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  40.58 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  39.9 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.67 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  39.9 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  40.49 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.32 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00865  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.34 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.34 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0966414  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  39.15 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3256  heme exporter protein CcmA  40.88 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1560  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.7 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0600798  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.47 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.18 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  38.24 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1617  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.7 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0182148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.38 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  40.61 
 
 		 212 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.92 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.89 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.56 
 
 		 200 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1683  heme exporter protein CcmA  36.27 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0918  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.87 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0887  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.87 
 
 		 200 aa  118  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  40.43 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0589  heme exporter protein CcmA  39.59 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0411  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.11 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  40.1 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.38 
 
 		 218 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.6 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0370  ABC heme exporter, ATPase subunit CcmA  33.17 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684252 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2113  heme exporter protein CcmA  38.81 
 
 		 213 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  39.58 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0999  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.53 
 
 		 204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>