More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4766 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  100 
 
 
226 aa  447  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  57 
 
 
211 aa  221  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2847  heme exporter protein CcmA  56.25 
 
 
210 aa  208  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0803665  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2441  heme exporter protein CcmA  55.77 
 
 
210 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43 
 
 
206 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0370  ABC heme exporter, ATPase subunit CcmA  45.67 
 
 
228 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1683  heme exporter protein CcmA  45.69 
 
 
236 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.72 
 
 
226 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.02 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.55 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.67 
 
 
208 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.9 
 
 
210 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.9 
 
 
210 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.9 
 
 
210 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  36.51 
 
 
205 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.04 
 
 
205 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.21 
 
 
204 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  44.79 
 
 
207 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  45.79 
 
 
215 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4989  heme exporter protein CcmA  40.89 
 
 
204 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  40.53 
 
 
210 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.98 
 
 
211 aa  141  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  41.94 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.41 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  40.1 
 
 
225 aa  139  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.51 
 
 
207 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.71 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0966414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00865  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.71 
 
 
214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238062  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.55 
 
 
217 aa  135  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.87 
 
 
211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  37.77 
 
 
215 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.1 
 
 
218 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  44.1 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.85 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3663  heme exporter protein CcmA  43.09 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  hitchhiker  0.00457456 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.21 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  41.15 
 
 
212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.56 
 
 
214 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  37.14 
 
 
212 aa  132  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.57 
 
 
218 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.27 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.45 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.57 
 
 
218 aa  132  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.27 
 
 
206 aa  131  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  42.78 
 
 
215 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.84 
 
 
216 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0589  heme exporter protein CcmA  47.12 
 
 
214 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.98 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.71 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  40.93 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  42.78 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  40.29 
 
 
202 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.22 
 
 
215 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.32 
 
 
219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  36.51 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.71 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.71 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.1 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1544  heme exporter protein CcmA  45.73 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.71 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.71 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.71 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.69 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1413  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.59 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.69 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  40.64 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.33 
 
 
200 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.7 
 
 
218 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.67 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.21 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.21 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.21 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0999  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.71 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15365  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.21 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.18 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  36.51 
 
 
236 aa  125  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.21 
 
 
208 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  37.23 
 
 
204 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.31 
 
 
200 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.21 
 
 
207 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40 
 
 
209 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.39 
 
 
202 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.67 
 
 
216 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2647  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.96 
 
 
211 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.122197  normal  0.0114626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.26 
 
 
216 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0459  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.19 
 
 
212 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.573877  normal  0.123941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  39.38 
 
 
229 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1855  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.06 
 
 
205 aa  121  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125429  normal  0.876599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.97 
 
 
200 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  38.74 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  38.86 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  38.74 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.86 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.86 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.86 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.86 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.04 
 
 
217 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.94 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.86 
 
 
205 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.22 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>