More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1383 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  73 
 
 		 215 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.74 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.21 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  50.25 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  46.31 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  46.07 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.95 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  49.22 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  48.95 
 
 		 210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.78 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.03 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.98 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  44.67 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  47.98 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  47.98 
 
 		 207 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.98 
 
 		 205 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  47.98 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.98 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.98 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.98 
 
 		 205 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  41.46 
 
 		 223 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.47 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.12 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.47 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.12 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.12 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  46.8 
 
 		 212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.98 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  48.26 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.97 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.14 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.98 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.82 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.45 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.82 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.38 
 
 		 216 aa  154  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.08 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  45.18 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.08 
 
 		 233 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.8 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.36 
 
 		 219 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.8 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.8 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.41 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.8 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  42.78 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.41 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.19 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 205 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.31 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.41 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 207 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.8 
 
 		 216 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.31 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.55 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.81 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3569  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.94 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.191066  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.55 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.8 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.55 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0948  Heme exporter protein CcmA  44.5 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.589324  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.07 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  40.7 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.81 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1544  heme exporter protein CcmA  44.9 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.31 
 
 		 211 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  43.59 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  43.59 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  43 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  44.1 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.28 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0213  heme exporter protein CcmA  39.8 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1683  heme exporter protein CcmA  40.82 
 
 		 236 aa  137  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.69 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.97 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  40.62 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3084  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.71 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3663  heme exporter protein CcmA  42.21 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  hitchhiker  0.00457456 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.51 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.41 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.72 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.02 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.9 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3256  heme exporter protein CcmA  44.1 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0589  heme exporter protein CcmA  43.43 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.12 
 
 		 209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.38 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  39.51 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.23 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.5 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0966414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>