More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1215 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  100 
 
 
220 aa  431  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1544  heme exporter protein CcmA  60.94 
 
 
234 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.08 
 
 
210 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.12 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.12 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.12 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.89 
 
 
233 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.02 
 
 
211 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.89 
 
 
234 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  41.71 
 
 
215 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.72 
 
 
207 aa  156  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.02 
 
 
214 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  45.19 
 
 
212 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.08 
 
 
215 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  45.18 
 
 
201 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.67 
 
 
211 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.33 
 
 
204 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.63 
 
 
226 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.51 
 
 
219 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  43.3 
 
 
210 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  43.26 
 
 
225 aa  148  7e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.5 
 
 
205 aa  145  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.71 
 
 
216 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  39.71 
 
 
236 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.93 
 
 
204 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.26 
 
 
214 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0966414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00865  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.26 
 
 
214 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.35 
 
 
218 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.35 
 
 
218 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.49 
 
 
216 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.35 
 
 
218 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  40.39 
 
 
205 aa  141  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.2 
 
 
216 aa  141  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.74 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1683  heme exporter protein CcmA  46.94 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.49 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  38.35 
 
 
223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.24 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.95 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.9 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.49 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  42.29 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40 
 
 
216 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.49 
 
 
216 aa  138  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.75 
 
 
206 aa  137  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40 
 
 
216 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.78 
 
 
208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.24 
 
 
216 aa  135  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3569  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.21 
 
 
227 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.191066  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.54 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.54 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.54 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.54 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.42 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  44.33 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.63 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.43 
 
 
221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.84 
 
 
212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  42.86 
 
 
188 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.93 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.88 
 
 
211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  43.65 
 
 
213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.22 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.22 
 
 
208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.22 
 
 
207 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.22 
 
 
207 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.22 
 
 
207 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.31 
 
 
206 aa  125  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.96 
 
 
210 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.78 
 
 
205 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  40.78 
 
 
207 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  40.78 
 
 
205 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.78 
 
 
205 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.22 
 
 
208 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.78 
 
 
205 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  40.78 
 
 
207 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.29 
 
 
205 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.78 
 
 
205 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.22 
 
 
207 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.22 
 
 
208 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.39 
 
 
200 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.8 
 
 
205 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1119  heme exporter protein CcmA  42.64 
 
 
191 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.927557  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1560  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.68 
 
 
215 aa  123  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0600798  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  46.41 
 
 
216 aa  123  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1617  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.93 
 
 
234 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0182148  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.72 
 
 
207 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.72 
 
 
205 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1829  ABC exporter, ATPase subunit CcmA  40.22 
 
 
209 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.33 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.32 
 
 
200 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1822  heme exporter protein CcmA  39.68 
 
 
194 aa  118  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  36.36 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2113  heme exporter protein CcmA  38.83 
 
 
213 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2164  heme exporter protein CcmA  35.75 
 
 
255 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  43.48 
 
 
215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  42.44 
 
 
215 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1855  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.04 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125429  normal  0.876599 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0370  ABC heme exporter, ATPase subunit CcmA  36.94 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684252 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  43.09 
 
 
215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>