More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2389 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  100 
 
 
207 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  99.03 
 
 
207 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  99.03 
 
 
207 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  99.02 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  98.07 
 
 
207 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  98.54 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  99.03 
 
 
207 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  99.02 
 
 
208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  99.02 
 
 
208 aa  403  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  98.05 
 
 
205 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  79.7 
 
 
207 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  79.7 
 
 
207 aa  310  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  78.05 
 
 
205 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  78.05 
 
 
205 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  78.05 
 
 
205 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  78.05 
 
 
205 aa  305  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  79.5 
 
 
205 aa  305  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  77.94 
 
 
205 aa  304  7e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  79 
 
 
205 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  59.71 
 
 
210 aa  247  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  60.1 
 
 
206 aa  246  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  59.61 
 
 
226 aa  241  5e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  55.83 
 
 
218 aa  230  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  55.83 
 
 
218 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  55.34 
 
 
218 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.47 
 
 
204 aa  214  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  54.19 
 
 
207 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  52.71 
 
 
205 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.2 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  51.92 
 
 
212 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50.5 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.99 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50 
 
 
216 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.47 
 
 
233 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.98 
 
 
216 aa  191  7e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.98 
 
 
216 aa  191  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.47 
 
 
234 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.28 
 
 
217 aa  189  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  52.22 
 
 
214 aa  187  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.21 
 
 
216 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  50.77 
 
 
223 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.68 
 
 
216 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  52.11 
 
 
211 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.68 
 
 
216 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.62 
 
 
216 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.62 
 
 
216 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.62 
 
 
216 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.88 
 
 
217 aa  185  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.62 
 
 
216 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.15 
 
 
216 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  53.96 
 
 
211 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.74 
 
 
210 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.74 
 
 
210 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.05 
 
 
219 aa  185  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  48.24 
 
 
236 aa  184  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  51.74 
 
 
210 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.15 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  49.25 
 
 
210 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  52.63 
 
 
212 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  50 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3569  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.97 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.191066  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  49.28 
 
 
212 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  49.23 
 
 
208 aa  174  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  47.85 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  47.89 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  49.48 
 
 
225 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.29 
 
 
204 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  43.84 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  46.56 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.2 
 
 
206 aa  161  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  43.39 
 
 
210 aa  154  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.61 
 
 
209 aa  153  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00865  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.99 
 
 
214 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  45.99 
 
 
214 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0966414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.04 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.71 
 
 
226 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0887  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.89 
 
 
200 aa  142  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  46.28 
 
 
215 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0918  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.89 
 
 
200 aa  142  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  44.22 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.33 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.64 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2847  heme exporter protein CcmA  42.72 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0803665  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.33 
 
 
215 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3663  heme exporter protein CcmA  46.81 
 
 
212 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  hitchhiker  0.00457456 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  41.18 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.67 
 
 
211 aa  138  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3256  heme exporter protein CcmA  48.45 
 
 
178 aa  138  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.8 
 
 
205 aa  138  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  45 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  46.2 
 
 
216 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.27 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  44.02 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  44.02 
 
 
215 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.21 
 
 
200 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  43.01 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0589  heme exporter protein CcmA  48.98 
 
 
214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1829  ABC exporter, ATPase subunit CcmA  40.72 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  39.8 
 
 
213 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2164  heme exporter protein CcmA  39.23 
 
 
255 aa  129  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>