More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1421 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1421  heme exporter protein CcmA  100 
 
 		 194 aa  362  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1822  heme exporter protein CcmA  56.7 
 
 		 194 aa  198  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99348  normal  0.178164 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1119  heme exporter protein CcmA  52.49 
 
 		 191 aa  161  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.927557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  47.24 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.16 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.43 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  43.94 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.06 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.06 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0213  heme exporter protein CcmA  46.11 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0040  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.17 
 
 		 233 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  43.88 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.56 
 
 		 200 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.68 
 
 		 200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  44.67 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  42.86 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  42.86 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.36 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1284  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.56 
 
 		 208 aa  127  9.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.339928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  42.29 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1855  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.14 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125429  normal  0.876599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.14 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3663  heme exporter protein CcmA  43.08 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  hitchhiker  0.00457456 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1413  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.96 
 
 		 210 aa  121  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.13 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3853  heme exporter protein CcmA  38.19 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  35.38 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  43.08 
 
 		 215 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.7 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  41.3 
 
 		 220 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0322  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.89 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  33.87 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.11 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0459  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.22 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.573877  normal  0.123941 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0447  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.78 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.62 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2860  heme exporter protein CcmA  40.11 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.584644 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2647  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.21 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.122197  normal  0.0114626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.17 
 
 		 221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0409  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.62 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1801  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.66 
 
 		 210 aa  111  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.29 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.69 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.47 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3569  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.63 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.191066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.47 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.84 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3084  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.32 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  37.7 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  37.7 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.7 
 
 		 205 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.7 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  37.7 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.27 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.7 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.7 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  35.57 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  32.62 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.05 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  32.63 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2847  heme exporter protein CcmA  32.5 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0803665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.22 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 		 207 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0205  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.02 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0526934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4989  heme exporter protein CcmA  39.09 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.65 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.16 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.3 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.65 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.02 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.11 
 
 		 216 aa  104  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0370  ABC heme exporter, ATPase subunit CcmA  34.91 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684252 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.11 
 
 		 216 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.11 
 
 		 216 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.11 
 
 		 216 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.11 
 
 		 216 aa  104  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.22 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.65 
 
 		 216 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  35.87 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  30.65 
 
 		 216 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.87 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.5 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.5 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1180  heme exporter protein CcmA  40.11 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  31.31 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.5 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.51 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.51 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0411  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.38 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.97 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.5 
 
 		 210 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  29.32 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.03 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>