More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2847 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2847  heme exporter protein CcmA  100 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0803665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2441  heme exporter protein CcmA  93.81 
 
 		 210 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  56.25 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.97 
 
 		 211 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.96 
 
 		 204 aa  155  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.47 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0370  ABC heme exporter, ATPase subunit CcmA  41.52 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0045  heme exporter protein CcmA  37.77 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4327  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.63 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1540  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.63 
 
 		 210 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  41.63 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  36.71 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.16 
 
 		 207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3896  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.15 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  41.94 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.71 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2699  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.33 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.21 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.21 
 
 		 215 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3663  heme exporter protein CcmA  45.6 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  hitchhiker  0.00457456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  42.11 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  34.76 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  42.58 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.04 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  42.11 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.11 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.44 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2791  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.28 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324914  normal  0.539608 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.78 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00865  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.43 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.238062  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.43 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0966414  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  39.71 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4989  heme exporter protein CcmA  40.98 
 
 		 204 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1413  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.58 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.767688  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3852  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.3 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.68 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  36.54 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  42.49 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  39.44 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.66 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.41 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45380  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.8 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  40.3 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.5 
 
 		 200 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  32.99 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.98 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.58 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.34 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.5 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.72 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.72 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.72 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1577  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.73 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3653  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.8 
 
 		 210 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.72 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.72 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.72 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  40.2 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.72 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.72 
 
 		 207 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.72 
 
 		 208 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.02 
 
 		 218 aa  122  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.02 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.21 
 
 		 215 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.02 
 
 		 218 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.09 
 
 		 206 aa  121  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3635  heme exporter protein CcmA  40.61 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.23 
 
 		 205 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1855  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.38 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125429  normal  0.876599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.07 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.27 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2385  heme exporter protein CcmA  39.39 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00141503  hitchhiker  0.0000187001 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  37.17 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.38 
 
 		 216 aa  118  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.07 
 
 		 210 aa  117  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  35.38 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1284  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.36 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.339928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.38 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0245  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.38 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000419227  hitchhiker  0.00343887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0589  heme exporter protein CcmA  44.06 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  39.9 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3084  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.41 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30450  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.81 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.33 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  40.4 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  39.15 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.15 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  40.4 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.15 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.15 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1960  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.32 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.4 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.4 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0887  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.99 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.68 
 
 		 205 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.85 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1034  cytochrome c biogenesis protein CcmA  33.85 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.359278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0918  cytochrome c biogenesis protein CcmA  32.99 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.38 
 
 		 216 aa  111  9e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2647  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.89 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.122197  normal  0.0114626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>