More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4989 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4989  heme exporter protein CcmA  100 
 
 
204 aa  394  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0524  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.94 
 
 
200 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0292  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.43 
 
 
200 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0314378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0200  cytochrome c biogenesis protein CcmA  44.9 
 
 
200 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0402446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1404  heme exporter protein CcmA  46.6 
 
 
213 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4766  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.89 
 
 
226 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0322  cytochrome c biogenesis protein CcmA  47.69 
 
 
200 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2860  heme exporter protein CcmA  46.52 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2635  heme exporter protein CcmA  45.99 
 
 
215 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5768  heme exporter protein CcmA  46.03 
 
 
212 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2759  heme exporter protein CcmA  45.99 
 
 
216 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4188  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.92 
 
 
221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0175  heme exporter protein CcmA  47.85 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.25008  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0409  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.24 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4062  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.58 
 
 
215 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.722912  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3663  heme exporter protein CcmA  47.31 
 
 
212 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.666894  hitchhiker  0.00457456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3415  heme exporter protein CcmA  40 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4060  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.81 
 
 
211 aa  128  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438117  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3508  heme exporter protein CcmA  41.41 
 
 
202 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00280297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3739  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.61 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2847  heme exporter protein CcmA  40.98 
 
 
210 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0803665  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3991  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.21 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0106  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.62 
 
 
205 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557498  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3391  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.29 
 
 
226 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2860  heme exporter protein CcmA  39.38 
 
 
214 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.584644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0381  cytochrome c biogenesis protein CcmA  48.44 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0395  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.89 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.183524 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1383  heme exporter protein CcmA  38.78 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.288119  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2059  heme exporter protein CcmA  42.19 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0094  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.78 
 
 
215 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1496  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.89 
 
 
218 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1387  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.89 
 
 
218 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1855  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.19 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.125429  normal  0.876599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0215  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.36 
 
 
216 aa  118  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0686674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0179  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.77 
 
 
216 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2281  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.89 
 
 
204 aa  118  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0092  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.25 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002841  cytochrome c biogenesis ATPase component CcmA  39.27 
 
 
205 aa  117  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.86 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1284  cytochrome c biogenesis protein CcmA  34.92 
 
 
208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.339928  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1866  ATP binding protein of heme exporter A  38 
 
 
223 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03135  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0954  heme exporter protein CcmA  42.02 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0999  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.69 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.15365  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0393  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.71 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3338  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.79 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2728  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.1 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0459  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.93 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.573877  normal  0.123941 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1645  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.74 
 
 
207 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3569  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.84 
 
 
227 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.191066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4004  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.22 
 
 
208 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0205  cytochrome c biogenesis protein CcmA  46.7 
 
 
201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0526934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02128  heme exporter subunit  40.43 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.854384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2339  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.43 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1458  heme exporter protein CcmA  40.43 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2500  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.43 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1449  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.43 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0740  cytochrome c biogenesis protein CcmA  40.43 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02087  hypothetical protein  40.43 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.809709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4030  cytochrome c biogenesis protein CcmA  43.32 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0190  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.9 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000146102  hitchhiker  0.00172001 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2424  cytochrome c biogenesis protein CcmA  38.17 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0370  ABC heme exporter, ATPase subunit CcmA  40.28 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000684252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4047  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.27 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03074  ATP binding protein of heme exporter A  37.57 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1518  heme exporter protein CcmA  36.7 
 
 
215 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4287  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.17 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000142733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3853  heme exporter protein CcmA  39.78 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4102  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.75 
 
 
208 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2349  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.89 
 
 
205 aa  109  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4209  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.75 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0708  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.34 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1215  heme ABC export system, ATP-binding protein CcmA  45.11 
 
 
220 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2438  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.78 
 
 
207 aa  108  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.065124  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3024  heme exporter protein CcmA  35.29 
 
 
212 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4659  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.23 
 
 
216 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000171074 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1801  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.89 
 
 
210 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3727  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.1 
 
 
216 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.549494  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1364  heme exporter protein CcmA  39.59 
 
 
225 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2597  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.78 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.984357  normal  0.326318 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0447  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.89 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2480  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.78 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4151  cytochrome c biogenesis protein CcmA  41.24 
 
 
208 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0295  cytochrome c biogenesis protein CcmA  31.66 
 
 
217 aa  107  9.000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.831759  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0263  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.56 
 
 
216 aa  107  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2389  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.25 
 
 
207 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1217  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.98 
 
 
206 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2494  cytochrome c biogenesis protein CcmA  42.25 
 
 
207 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3084  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.36 
 
 
207 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.99362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.48 
 
 
216 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000507963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.48 
 
 
216 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00963254  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4024  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.48 
 
 
216 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00131929  hitchhiker  0.0000298628 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1180  heme exporter protein CcmA  39.09 
 
 
205 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0228  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.48 
 
 
216 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0024682  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.56 
 
 
216 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.196504  unclonable  0.0000000000426589 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1683  heme exporter protein CcmA  41.75 
 
 
236 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0226  cytochrome c biogenesis protein CcmA  36.02 
 
 
216 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1544  heme exporter protein CcmA  41.51 
 
 
234 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.123842 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0231  cytochrome c biogenesis protein CcmA  35.48 
 
 
216 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0147409  unclonable  0.0000000000310337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2647  cytochrome c biogenesis protein CcmA  39.06 
 
 
211 aa  104  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.122197  normal  0.0114626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>