68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0898 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0898  ATP/GTP-binding protein  100 
 
 		 309 aa  622  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4662  ATP/GTP-binding protein  48.46 
 
 		 315 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1006  ATP/GTP-binding protein  45.99 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.949119  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0275  citrate lyase beta subunit-like  43.13 
 
 		 316 aa  235  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0938  hypothetical protein  44.07 
 
 		 316 aa  228  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0806  hypothetical protein  42.72 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1345  ATP/GTP-binding protein  43.14 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0085  citrate lyase beta subunit-like protein  39.69 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3689  hypothetical protein  39.74 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.626014  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3882  hypothetical protein  41.06 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0657  hypothetical protein  40.73 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0671404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3794  hypothetical protein  40.73 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569922  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0755  hypothetical protein  35.62 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0752  hypothetical protein  36.22 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3189  hypothetical protein  30.5 
 
 		 385 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5091  hypothetical protein  28.79 
 
 		 367 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3013  hypothetical protein  30.36 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000857475  decreased coverage  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5097  ATP/GTP-binding protein  28.01 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0143  ATP/GTP-binding protein  28.01 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1062  putative ATP/GTP-binding protein  30.09 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33920  citrate lyase beta subunit  29.33 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.878641  normal  0.357837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4761  hypothetical protein  31.62 
 
 		 389 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3307  putative citrate lyase beta subunit  30.06 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22999  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0340  putative ATP/GTP-binding protein  28.45 
 
 		 381 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0579  hypothetical protein  27.2 
 
 		 392 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.638889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3670  citrate lyase beta subunit-like  28.77 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.568716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0233  Citryl-CoA lyase  26.2 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.020258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2212  Citrate (pro-3S)-lyase  25.79 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0511  HpcH/HpaI aldolase  26.18 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3632  HpcH/HpaI aldolase  28.95 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  24.1 
 
 		 285 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3700  HpcH/HpaI aldolase  28.95 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3627  HpcH/HpaI aldolase  28.95 
 
 		 272 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0858993  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  24.4 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3362  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.74 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3369  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.74 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.988595  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  31.48 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  24.1 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3295  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.38 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.820787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3464  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  34.74 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.761974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  31.48 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2156  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.07 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.928394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  27.68 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2118  HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase family protein  28.07 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2266  HpcH/HpaI aldolase  28.07 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1188  Citryl-CoA lyase  28.08 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0232  Citryl-CoA lyase  24.81 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0359  Citryl-CoA lyase  27.64 
 
 		 277 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  25.36 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  27.52 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0168  citrate lyase, beta subunit, putative  25.82 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0332252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0149  putative citrate lyase, beta subunit  25.82 
 
 		 274 aa  46.2  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0826  putative citrate lyase, beta subunit  30.19 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1243  HpcH/HpaI aldolase  23.81 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.31934  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  22.86 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  22.86 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3520  Citryl-CoA lyase  23.02 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.897264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  26.86 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2324  Citrate (pro-3S)-lyase  29.29 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  22.98 
 
 		 379 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3913  HpcH/HpaI aldolase  33.73 
 
 		 282 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.939389  normal  0.094583 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  25.94 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0563  Citryl-CoA lyase  27.11 
 
 		 279 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.293195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  24 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2556  HpcH/HpaI aldolase  28.93 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.404937 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  25.91 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6334  Citrate (pro-3S)-lyase  25.3 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133288  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  25.77 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>